« URGI » : différence entre les versions

URGI
Nom développé	Unité Ressources Génomique-Info
Autres noms	URGI, US 1164
URL	https://urgi.versailles.inrae.fr
Tutelles	INRAE
Identifiants
RNSR	200217796P
Identifiant dans un autre catalogue	https://www.ifb-elixir.fr/ifb-elixir-fr/nos-plateformes/urgi/ (IFB)
Localisation	Versailles
Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://urgi.versailles.inra.fr/Platform
Contact	urgi-contact@inrae.fr
Structure d'appartenance	URGI, IFB

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Version du 22 décembre 2025 à 16:53

Page en construction

L'URGI (Unité Ressources Génomique-Info) est une unité de service spécialisée en bioinformatique des plantes. Elle intègre les données de génétique, phénomique et génomique, principalement de plantes, et analyse la dynamique des éléments transposables dans les génomes et les pangénomes.

L'URGI est certifiée ISO 9001:2015 et fait partie de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB), le noeud français d'ELIXIR, l'infrastructure européenne de bioinformatique pour les sciences de la vie. C'est également l'une des quatre plateformes qui forme BioinfOmics, l'infrastructure de recherche en bioinformatique de l'INRAE.

L’URGI propose une gamme de services pour l'accompagnement de projets, avec des solutions sur mesure et une expertise reconnue :

Conseils et ressources pour la gestion et l'intégration de données selon les principes FAIR, pour assurer leur accessibilité, interopérabilité et réutilisation
Développement de portails fédératifs pour faciliter l'accès et l'exploitation de données mondiales (FAIDARE, WheatIS Data Discovery, RARe Data Discovery)
Analyse avancée des données génomiques avec des outils spécialisés, comme REPET.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

Biologie
Environnement
Informatique
Plateforme de bioinformatique

Type de données :Données génétique, données phénomique, données génomiques

Périmètre de communauté : thématique, national, international

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de l'INRAE et ses partenaires

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, bioinformaticiens

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : L'URGI propose différents services dont le contour et les conditions d'accès sont décrits sur son site web :

gestion et publication de données FAIR : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
fédérations de données : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
annotation d'éléments transposables : https://urgi.versailles.inrae.fr/Annotation/Service

Il est également possible de solliciter l'URGI par mail à l’adresse urgi-contact@inrae.fr.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2025 (https://urgi.versailles.inrae.fr/Quality)

IBiSA ([https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html%0ACNOC_INRAE https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html CNOC INRAE])

Conditions générales d'utilisation : https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use

URGI est en lien avec les services et structures

IFB, ELIXIR, France Génomique, BioinfOmics, INRAE, Université Paris-Saclay, RARe, Phenome-Emphasis France

Portée internationale de URGI

WheatIS (https://www.wheatinitiative.org/wheatis)

IWGSC (https://www.wheatinitiative.org/wheatis)

Offre de services de URGI

GnpIS (Entrepôt de données)
URGI (Plateforme d'accès)
WheatIS (Plateforme d'accès)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM URGI GenomiqueENS Biomics TGML MGX GenomEast GENOMAX UCA Genomix PSI2BC ICGex
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet URGI Migale DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur InforBio Madbot
URGI	URGI GnpIS WheatIS
Université Paris-Saclay	Université Paris-Saclay : Données de la recherche URGI MesoUPSaclay DatASaclay Université Paris-Saclay : Entrepôt Saclay Lab-IA Paris-Saclay GitLab

@@ Ligne 3 : / Ligne 3 : @@
 |Nom=URGI
 |NomDéveloppé=Unité Ressources Génomique-Info
-|NomAlternatifRéduit=US 1164
+|NomAlternatifRéduit=URGI, US 1164
 |UrlStructure=https://urgi.versailles.inrae.fr
 |Tutelle=INRAE
 |IDRNSR=200217796P
+|IdentifiantAlternatif=https://www.ifb-elixir.fr/ifb-elixir-fr/nos-plateformes/urgi/;IFB
 |Localisation=Versailles
 |TypeService=Plateforme de calcul
@@ Ligne 13 : / Ligne 14 : @@
 |ContactMel=urgi-contact@inrae.fr
 |StructureAppartenance=URGI, IFB
-|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage
+|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Exposition
 }}
 {{Coordonnées GPS
@@ Ligne 19 : / Ligne 20 : @@
 }}
 {{ServiceStructure
-|Description=L''''URGI''' (Unité Ressources Génomique-Info) est une '''unité de service spécialisée en bioinformatique'''. Elle intègre les données de génétique, phénomique et génomique, principalement de plantes, et analyse la dynamique des éléments transposables dans les génomes et les pangénomes.
+|Description=L''''URGI''' (Unité Ressources Génomique-Info) est une '''unité de service spécialisée en bioinformatique des plantes'''. Elle intègre les données de génétique, phénomique et génomique, principalement de plantes, et analyse la dynamique des éléments transposables dans les génomes et les pangénomes.
 L'URGI est '''certifiée ISO 9001:2015''' et fait partie de l'[[IFB|Institut Français de Bioinformatique (IFB)]], le noeud français d'[[ELIXIR|ELIXIR]], l'infrastructure européenne de bioinformatique pour les sciences de la vie. C'est également l'une des quatre plateformes qui forme BioinfOmics, l'infrastructure de recherche en bioinformatique de l'[[INRAE|INRAE]].
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 * '''Analyse avancée des données génomiques''' avec des outils spécialisés, comme REPET.
 |Discipline=Vie & Santé
-|SousDisciplineVie&Sante=LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
+|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
-|Thematique=Biologie, Agro-alimentaire, Environnement, Informatique
+|Thematique=Biologie, Environnement, Informatique, Plateforme de bioinformatique
+|TypeDonnee=Données génétique, données phénomique, données génomiques
+|PerimetreCommunaute=thématique, national, international
+|Communaute=Communauté scientifique de l'INRAE et ses partenaires
+|Beneficiaire=Chercheurs, bioinformaticiens
 |Science ouverte=Politique de données
 |Politique de données=https://doi.org/10.15454/9HM5UI
+|ConditionUsage=L'URGI propose différents services dont le contour et les conditions d'accès sont décrits sur son site web :
+* gestion et publication de données FAIR : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
+* fédérations de données : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
+* annotation d'éléments transposables : https://urgi.versailles.inrae.fr/Annotation/Service
+Il est également possible de solliciter l'URGI par mail à l’adresse urgi-contact@inrae.fr.
 |Certification=ISO 9001:2025;https://urgi.versailles.inrae.fr/Quality, IBiSA;https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html
-|Relation=IFB, ELIXIR, France Génomique, BioinfOmics, INRAE, Université Paris-Saclay
+CNOC INRAE;https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform
+|Cgu=https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use
+|Relation=IFB, ELIXIR, France Génomique, BioinfOmics, INRAE, Université Paris-Saclay, RARe, Phenome-Emphasis France
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 |StatutPage=Page en construction
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