LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes

Biotechnologie utilisant tous les organismes, biotechnologie pour les applications environnementales et alimentaires, sciences appliquées aux plantes et aux animaux, bioingénierie et biologie synthétique, biomasse et biocarburants, risques biologiques

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Légende : Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche Service Structure

Acronyme	Nom développé	Type de service	Thématique/Mots clés	Localisation
AFMB	Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques		Complexes Macromoléculaires Viraux Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire Glycobiologie et Neurobiologie Structurales Glycogénomique Interactions hôte-pathogène Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design	Marseille
AGAP	Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales		Agrobiodiversité	Montpellier Guadeloupe Martinique
Adonis	Acquisition de DONnéeS à l’INRAE	Outils de gestion des données	Saisie données d'observation Expérimentation de terrain Logiciel
AgroPortal		Outils de gestion des données	Agroalimentaire Agriculture Ontologie Ressource sémantique Artefact sémantique	Montpellier
AnaEE-France Metadata Catalog		Plateforme d'accès	Écosystèmes continentaux
Anexplo		Plateforme d'acquisition	Phénotypage animal	Toulouse
AniRA	Plateforme régionale Ani-Rhone-Alpes	Plateforme d'acquisition		Lyon
Anses	Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail			Maisons-Alfort
B-BEST	Biomasses, biotechnologies et technologies durables pour la chimie et les carburants		Produits biosourcés Chimie durable Biocarburants Biotechnologies Énergie
BALISTE	Base de données naturalistes partagée	Outils de gestion des données	Protocoles Méthodes d'observation	Paris
BIII	BioImage Informatics Index	Plateforme d'accès	Bioimagerie Analyse d'images	Nantes
BIOBANQUE
BIP	Bioénergétique et Ingénierie des Protéines		Bioénergétique Ingénierie des protéines	Marseille
BioEmergences	Dynamiques multiéchelles dans la morphogenèse	Plateforme d'accès	Morphogenèse Imagerie biomédicale	Gif-sur-Yvette
Biothérapies	Biothérapies et Bioproduction de Thérapies Innovantes		Bioproduction Thérapies géniques Thérapies cellulaires Thérapies tissulaires
Bordeaux Sciences Agro	École Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine		Agronomie Œnologie Vin	Gradignan
CAD	Collecteur Analyseur de Données			Bruyères-le-Châtel
CALIS	Infrastructure Nationale de Recherche Consommateur-ALIment-Santé		Agronomie Alimentation Santé	Rennes
CCMA	Centre Commun de Microscopie Appliquée	Plateforme d'acquisition		Nice
CESCO	Centre d'Écologie et des Sciences de la COnservation			Paris Brunoy Concarneau
CID	Cochin Image Database	Entrepôt de données	Imagerie Cytométrie Protéomique	Paris
CNRGV	Centre National de Ressources Génomiques Végétales	Plateforme d'acquisition	Génomique végétale	Castanet Tolosan
CNRS Biologie	Institut des sciences biologiques du CNRS			Paris
CSGA	Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation		Consommateur Perception sensorielle Conditions physiologiques ou physiopathologiques Aliment	Dijon
Celphedia	Création Elevage PHénotypage Distribution et Archivage d’organismes modèles			Illkirch-Graffenstaden
ChemBioFrance	Plateforme de découverte de molécules bioactives pour comprendre et soigner le vivant			Montpellier Illkirch-Graffenstaden
Chronobiotron		Plateforme d'acquisition		Strasbourg
Cid.curie.fr	Curie Image Database	Entrepôt de données	Imagerie médicale Algorithme d'analyse Microscopie électronique	Paris
Cirad Dataverse	Entrepôt de données de recherche du Cirad	Entrepôt de données	Agriculture Alimentation Environnement Gestion des territoires	Montpellier
Data INRAE	Espace institutionnel de données INRAE	Entrepôt de données	Écologie Science appliquée des végétaux et des animaux Science des aliments Métadonnées DataCite Dataverse Espace institutionnel Citation	Versailles
DataSuds	Des données ouvertes pour une science durable au Sud	Entrepôt de données	Sciences environnementales Sciences sociales Sciences biologiques Santé DOI Dataverse	Marseille
Dinamis	Dispositif Institutionnel National d’Approvisionnement Mutualisé en Imagerie Satellitaire	Plateforme d'accès	Imagerie satellitaire	Montpellier
DyNAFOR	Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers		Écologie des paysages Géographie sociale Télédétection Biologie de la conservation Agronomie	Auzeville
ECCOREV	Écosystèmes continentaux et risques environnementaux			Aix-en-Provence
ECELLFrance	Plateforme nationale pour la médecine régénératrice basée sur les cellules souches mésenchymateuses adultes			Montpellier
ECOBIOP	Écologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons		Écologie expérimentale Populations piscicoles	Saint-Pee-Sur-Nivelle
EMBRC ERIC	European Marine Biological Resource Centre			Paris
EMBRC France	Centre National de ressources biologiques marines			Paris Banyuls-sur-Mer Roscoff Villefranche-sur-Mer
EMERG'IN	Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l’exploration in vivo			Nouzilly
EMPHASIS	European Infrastructure for Multi-scale Plant Phenomics and Simulation			Jülich (Allemagne) Montpellier
EPGV	Étude du Polymorphisme des Génomes Végétaux	Plateforme d'acquisition	Séquençage Génotypage haut débit Polymorphisme des génomes	Evry
EPSI	Plateforme Exercice Performance Santé Innovation	Plateforme d'acquisition	Activité physique adaptée Santé Physiologie intégrée Physiopathologie Sciences du mouvement humain	Besançon
ESE	Écologie, Systématique et Évolution			Paris
ESTHER database	ESTerases and alpha/beta-Hydrolase Enzymes and Relatives database	Entrepôt de données	Hydrolases alpha/beta-Hydrolase fold Esterases Cholinestérases Acétylcholinestérase Bioinformatique Homme Souris Relation structure fonction Résidus site actif Mutation génétique Maladies Résistance insecticide	Montpellier
EU-IBISBA	European Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator			Toulouse
EcogenO	Plateforme d'Éco-Génomique Ecogeno	Plateforme d'acquisition	Plateforme de Génomique environnementale	Rennes
Ecotron Européen de Montpellier		Plateforme d'acquisition		Montferrier-sur-Lez
FEMTO-ST	Institut Franche-Comté Électronique Mécanique Thermique et Optique – Sciences et Technologies		Micro et nano-acoustique Micro-nano-optique Microrobotique Sillicium MOEMS	Besançon
FairCarboN	Carbone et Écosystèmes continentaux - leviers et trajectoires pour la neutralité carbone		Changement climatique Modèles numériques Biogéochimie Neutralité climatique Empreinte carbone
FooSIN	Projet FooSIN - Participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network	Outils de gestion des données	Principes FAIR Ressources sémantiques Ontologies Thésaurus Agriculture Agroalimentaire	Paris
GDEC	Génétique Diversité et Écophysiologie des Céréales		Blé tendre Génomique et génétique des céréales	Clermont-Ferrand
Geoflow INRAE		Outils de gestion des données	Workflow Données FAIR	Paris
Geosur	Centre de données et de services de l'OSU-Réunion	Plateforme d'accès	Observation atmosphère Pacifique Sud Lidar	Saint-Denis de La Réunion
GnpIS	Genetic and Genomic Information System	Entrepôt de données	Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences Cartographie Génomique comparative	Versailles
Génomique Métabolique
Géoportail	Portail national de la connaissance du territoire	Plateforme d'accès	Infrastructure nationale d'information géographique Géomatique Environnement Aménagement du territoire Biodiversité Surfaces et Interfaces continentales	Saint Mandé
IBISBA France	Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Acceleration			Ramonville Saint-Agne
IMAG'IC	Plateforme d'imagerie photonique de l'Institut Cochin	Plateforme d'acquisition	Imagerie moléculaire et cellulaire Imagerie tissulaire Imagerie intravitale	Paris
IMBE	Institut Méditerranéen de la Biodiversité et d’Écologie marine et continentale			Marseille
IMEV	Institut de la Mer de Villefranche		Océan et environnement Système Terre et environnement	Villefranche-sur-Mer
IN-Sylva France	Infrastructure Nationale de recherche pour la gestion adaptative des forêts			Champenoux
INFRAFRONTIER	European Research Infrastructure for the generation, phenotyping, archiving and distribution of mouse disease models			Munich (Allemagne)
INGESTEM	Infrastructure nationale des cellules souches pluripotentes et ingénierie tissulaire			Villejuif
INRAE Genomics	INRAE Infrastructure de recherche distribuée en Génomique	Plateforme d'acquisition	Séquençage de génomes de novo Polymorphisme génétique Expression Régulation de l’expression Métagénomique.	Clermont-Ferrand Toulouse Castanet Tolosan Evry Cestas
INRAE-DipSO	Direction pour la science ouverte INRAE		Science ouverte	Paris
IPHC	Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien			Strasbourg
IPS2	Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay			Orsay
Ichthyop	Lagrangian tool for simulating ichthyoplankton dynamics	Outils de gestion des données	Écologie marine Écosystèmes marins Dispersion d'organismes	Sète
Institut Agro	Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture		Agronomie Agriculture Alimentation Environnement Vin Horticulture	Dijon Montpellier Rennes
IntelEspace		Plateforme d'acquisition	Géomatique Cartographie Archéologie Géosciences Agriculture	Clermont-Ferrand
Isara	Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes		Agronomie Agroalimentaire Environnement Agroécologie Systèmes alimentaires durables	Lyon Avignon
Isara : Entrepôt		Entrepôt de données	Métadonnées Espace institutionnel Citation	Lyon Avignon
LAE	Laboratoire Agronomie et Environnement			Vandoeuvre-les-Nancy Colmar
LBM (UMR 5200)	Laboratoire de Biogenèse Membranaire		Biotechnologie Biologie moléculaire Lipides Dynamique membranaire	Villenave d'Ornon
LBTI	Laboratoire de Biologie Tissulaire et d’Ingénierie thérapeutique		Peau Tissu cutané Cicatrisation Ciblage de molécules thérapeutiques Réparation tissulaire Recherche OstéoArticulaire et Dentaire Vecteurs colloïdaux	Lyon
LEEISA	Laboratoire écologie évolution interactions des systèmes amazoniens			Cayenne Guyane fançaise
LPE	Laboratoire Phénotypage-Endocrinologie	Plateforme d'acquisition	Physiologie Reproduction des animaux Hormone	Nouzilly
Laboratoire de Fougères : Service IST	Anses Laboratoire de Fougères Service d’information scientifique et technique	Accompagnement	Gestion de données de recherche Plan de gestion de données Sécurité alimentaire Médecine vétérinaire Hygiène alimentaire	Fougères
LiPh@SAS	Livestock Phenotyping for Sustainable Agricultural Systems		Alimentation Santé	Paris
MARBEC	MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation		Biologie marine Écosystèmes marins Biodiversité marine	Sète
MEANS	Plateforme MulticritEria AssessmeNt of Sustainability	Plateforme d'accès	Analyse multicritère Durabilité des systèmes	Rennes
MERMeX	Marine Ecosystems Response in the Mediterranean Experiment	Entrepôt de données	Bassin méditerranéen Écosystème marin Biodiversité Changement climatique Modélisation	Toulouse
MIA	Mathématiques et Informatique Appliquées - Paris-Saclay		Modélisation Apprentissage statistique Apprentissage informatique	Palaiseau
MICA	Microscopie Imagerie Cytométrie Azur	Plateforme d'acquisition	Microscopie électronique Microscopie à force atomique Microscopie de fluorescence Microscopie confocale Super-résolution PALM STED TIRF FLIM Microscopie à feuille de lumière Cytométrie en flux Cytométrie spectrale Tri cellulaire Imagerie du plancton Taxonomie du plancton Analyse d’images quantitative	Villefranche sur Mer Nice Biot Valbonne
MIO	Institut Méditerranéen d'Océanologie		Caractéristiques géographiques de l'océan Surveillance de l'environnement Répartition des espèces Mer Méditerranée Océan Pacifique	Marseille
MIRRI	Microbial Ressource Research Infrastructure			Braga (Portugal)
MetaboHUB	Infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique			Villenave d'Ornon
O3HP	Oak Observatory at OHP	Plateforme d'acquisition	Biodiversité Forêt méditerranéenne Changements climatiques Chênes pubescents	Saint Michel l'Observatoire
ODK INRAE	OpenDataKit INRAE	Outils de gestion des données	Sciences participatives	Paris
OENO	Unité de recherche œnologie		Vin Microorganismes	Villenave d’Ornon
ORDaR	OTELo Research Data Repository	Entrepôt de données		Vandoeuvre-les-Nancy
OSERen	Observatoire des Sciences de l'Environnement de Rennes		Système Terre et environnement	Rennes
OTELo	Observatoire Terre et Environnement Lorraine			Vandoeuvre-les-Nancy
OpenImadis	Open Image Discovery: A paltform for Image Life Cycle Management	Outils de gestion des données	Imagerie médicale Gestion de données Visualisation Annotation	Paris Nantes
PAM	Plateforme d'Analyse du Mouvement	Plateforme d'acquisition	Biomécanique Cinématique Cinétique Electrophysiologie Oculométrie Motion Capture Analyse du Mouvement Humain Motricité	Bordeaux
PGT	Pre industrial Gene Therapy consortium
PGTB	Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux	Plateforme d'acquisition	Génomique Séquençage Génotypage Biodiversité Metabarcoding Longs-reads Bioanalyse	Cestas
PHENOMIN	French National Infrastructure for Mouse Phenogenomics		Phénogénomique
PHENOMIN-CIPHE	Centre d’Immunophénomique	Plateforme d'acquisition		Marseille
PHENOMIN-ICS	Institut Clinique de la Souris	Plateforme d'acquisition		Illkirch-Graffenstaden
PHENOMIN-TAAM	Typage et Archivage d'Animaux Modèles	Plateforme d'acquisition		Orléans
PIC	Plateau d'Imagerie Cellulaire	Plateforme d'acquisition	Microscopie photonique Biologie de la reproduction Neurobiologie	Nouzilly
PIV	Plateforme Imageries du Vivant de l’Institut Cochin	Plateforme d'acquisition	Explorations physiologiques & fonctionnelles Imagerie in vivo Recherche pré-clinique	Paris
PIXANIM	Phénotypage par Imagerie in et ex vivo de l'Animal à la Molécule	Plateforme d'acquisition	Phénotypage Métabolomique Exploration fonctionnelle IRM	Nouzilly
PLBS	Plateformes Lilloises en Biologie Santé		Biologie et santé	Lille
PO²	Process & Observation Ontology	Outils de gestion des données	Ontologie Structure des aliments Nutrition Sciences alimentaires	Palaiseau
PPanGGOLiN	Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors	Outils de gestion des données	Logiciel Pangénomique Génomique comparative	Evry
PRC	Physiologie de la reproduction et des comportements		Neuroendocrinologie Biologie du comportement Biologie de la reproduction Biologie systémique et de la modélisation	Nouzilly
Phenome-Emphasis France	Infrastructure Francaise de Phenomique Végétale			Montpellier
PlantBioInfoPF	Plant Bioinformatics Facility	Plateforme de calcul	Plateforme de bioinformatique	Versailles
Puéchabon	Site expérimental de Puéchabon	Plateforme d'acquisition	Écosystème forestier méditerranéen Changements climatiques Biodiversité	Puéchabon
RARe	Ressources Agronomiques pour la Recherche			Jouy-en-Josas
RECOVER	Risques ECOsystèmes Vulnérabilité Environnement Résilience			Le Tholonet
SAS	Sol Agro et hydrosystème Spatialisation			Rennes Quimper
SFR Biosciences
SFR Santé Lyon Est	Fédération de Recherche Louis Léopold Ollier			Lyon
SILABE	Simian Laboratory Europe	Plateforme d'acquisition	Primates non-humains	Niederhausbergen
SPlotOpen		Plateforme d'accès	Biodiversité Communautés végétales terrestres Changements globaux Changements climatiques Écologie	Leipzig (Allemagne)
SVA	Sélection Végétale Avancée		Édition des génomes Génomique
SYGADE		Plateforme d'accès	Entretien	Paris
Science ouverte INRAE		Information	Identifiants pérennes Plan de gestion de données Supports de formation Tutoriels Ontologies Zenodo INRAE Principes FAIR Science ouverte Bonnes pratiques Agronomie Agriculture Alimentation Environnement	Paris
TEFOR	Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles			Illkirch
TEFOR Fly Facility		Plateforme d'acquisition	Drosophile Ingénierie génétique Phénotypage	Clermont-Ferrand
TEFOR Paris Saclay	Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay	Plateforme d'acquisition	Poisson zèbre Autres poissons modèles Modèles aquatiques Zootechnie Production de lignées d'intérêt Imagerie Reconstitution 3D Gestion de données Édition du génome	Saclay
TEFOR-TACGENE		Plateforme d'acquisition		Paris
TETIS	Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale		Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale	Montpellier
TETIS : Plateformes de données	Plateformes de données de UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale	Entrepôt de données	Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale	Montpellier
TRIP	Transgenic Rats Immunophenomic Platform	Plateforme d'acquisition		Nantes
Tela Botanica		Plateforme d'accès	Botanique Sciences participatives	Montpellier
Théia Animation régionale		Accompagnement	Télédétection Observation spatiale Surfaces et Interfaces continentales
URGI	Unité Ressources Génomique-Info		Biologie Agro-alimentaire Environnement Informatique	Versailles
WheatIS		Plateforme d'accès	Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences	Versailles
e-RECOLNAT	Portail du réseau des collections naturalistes françaises e-ReColNat	Plateforme d'accès	Botanique Zoologie Paléontologie Biodiversité Géodiversité Collections naturalistes Herbier Interopérabilité Darwin Core	Paris

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