GenOuest

De Cat OPIDoR
GenOuest
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Plateforme GenOuest, Plateforme de bio-informatique de Rennes, GenOuest bioinformatics, UMR 6074
URL https://www.genouest.org/
Contact https://www.genouest.org/contact/
Localisation Rennes
Structure d'appartenance IFB, IRISA
Tutelles CNRS, Inria, Université de Rennes


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La plate-forme GenOuest offre l'accès à un environnement bio-informatique complet combinant :
  • une infrastructure bioinformatique matérielle et logicielle (reposant sur un cluster et un cloud);
  • le développement d’applications bioinformatiques (environnements, interfaces, bases de données publiques, outils et chaînes de traitements,…) ;
  • une expertise et une consultance (les scientifiques peuvent bénéficier d’une expertise pour l’analyse de leurs données ou pour l’élaboration de stratégies d’analyse bioinformatiques) ;
  • des formations ;
  • de l’hébergement scientifique (les utilisateurs peuvent mettre en place de nouvelles ressources et/ou valoriser leurs travaux scientifiques grâce à la mise en place de sites ou applications web).

Cet environnement de calcul est exploitable de diverses façons : cluster, cloud privé, portail web. La plateforme s’intéresse particulièrement aux nouvelles modalités de calcul (virtualisation, cloud computing, portails de calcul) ainsi qu’à la gestion des données et des métadonnées en Biologie.

Grâce au projet CeSGO, GenOuest propose un ensemble d'outils collaboratifs pour gérer au mieux les projets et données scientifiques. GenOuest assure également le transfert technologique des nouveaux outils issus de la recherche en bio- informatique de l'Institut dont elle dépend.

Plateforme CNRS Sciences informatiques qui est un site d'implantation de l'Institut Francais de Bioinformatique


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique
  • Développement logiciel
  • Analyse de données
  • Gestion de données
  • Base de données
  • Calcul scientifique
  • Bioinformatique
  • Cloud computing
  • e-infrastructure
  • Environnement Virtuel de Recherche
  • Formation

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage : Pour accéder aux services proposés par la plateforme il est nécessaire d'ouvrir un compte. La demande de compte s'effectue en ligne sur le site de GenOuest

Modèle économique : L'ouverture de compte est gratuite pour le moment

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

CNOC INRAE (http://wiki.inra.fr/wiki/prodinra/Indexation/Mentionner+Plateformes+INRA)

Conditions générales d'utilisation :

GenOuest est en lien avec les services et structures

France Génomique, MetaboHUB, Biogenouest, GenScale

Portée internationale de GenOuest

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
VirHostNet
ARTbio
DAC
FAIR-Checker
IRISAGenOuest