ABiMS

De Cat OPIDoR
ABiMS
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science.
URL http://abims.sb-roscoff.fr
Contact support.abims@sb-roscoff.fr
Localisation Roscoff
Structure d'appartenance IFB, SBR
Tutelles CNRS, Sorbonne Université


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science, met à disposition une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows(outils, portail,...) .

ABiMS est partie intégrante de la Station Biologique de Roscoffet est rattachée au Service Informatique et Bioinformatique. Elle est intégrée à l’Institut Français de Bio-informatique (IFB) et à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et l’analyse des données issues du monde marin (algues, poissons, cyanobactéries, picoplancton...), et sont en lien direct avec les 2 axes de recherche de la Station Biologique que sont la biologie et l'écologie. ABiMS interagit avec les équipes de recherche dans le cadre de collaborations scientifiques formalisées, ou sous la forme de prestations.

Mise à disposition d’une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows (outils, portail...).


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Modèle économique :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (http://abims.sb-roscoff.fr/sites/abims.sb-roscoff.fr/files/paq.pdf)

IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

ABiMS est en lien avec les services et structures

EMBRC France, France Génomique

Portée internationale de ABiMS

EMBRC ERIC (http://www.embrc.eu/)

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
VirHostNet
ARTbio
DAC
SBRABiMS
SulfAtlas