LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes

Biotechnologie utilisant tous les organismes, biotechnologie pour les applications environnementales et alimentaires, sciences appliquées aux plantes et aux animaux, bioingénierie et biologie synthétique, biomasse et biocarburants, risques biologiques

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Légende : Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche Service Structure

Acronyme	Nom développé	Type de service	Thématique/Mots clés	Localisation
AFMB	Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, UMR 7257		Complexes Macromoléculaires Viraux Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire Glycobiologie et Neurobiologie Structurales Glycogénomique Interactions hôte-pathogène Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design	Marseille
AGAP	Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales, UMR 108, UMR 1334		Agrobiodiversité	Montpellier Guadeloupe Martinique
Adonis	Acquisition de DONnéeS à l’Inra	Outils de gestion des données	Saisie données d'observation Expérimentation de terrain Logiciel
AnaEE-France Metadata Catalog		Plateforme d'accès	Écosystèmes continentaux
Anexplo		Plateforme d'acquisition	Phénotypage animal	Toulouse
AniRA	plateforme régionale Ani-Rhone-Alpes	Plateforme d'acquisition		Lyon
Anses	Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail
Anses Laboratoire de Fougères Service IST	Anses Laboratoire de Fougères Service d’information scientifique et technique	Accompagnement	Gestion de données de recherche Plan de gestion de données Sécurité alimentaire Médecine vétérinaire Hygiène alimentaire	Fougères
B-BEST	PEPR B-BEST, Biomasses, biotechnologies et technologies durables pour la chimie et les carburants		Produits biosourcés Chimie durable Biocarburants Biotechnologies Énergie
BALISTE	Base de données naturalistes partagée	Outils de gestion des données	Protocoles Méthodes d'observation	Paris
BIII	BioImage Informatics Index, BISE	Plateforme d'accès	Bioimagerie Analyse d'images	Nantes
BIOBANQUES	Infrastructure nationale BIOBANQUES,US 13
BIP	Bioénergétique et ingénierie des protéines, UMR 7281		Bioénergétique Ingénierie des protéines	Marseille
BioEmergences	Dynamiques multiéchelles dans la morphogenèse, Multilevel Dynamics in Morphogenesis, FRE 2039	Plateforme d'accès	Morphogenèse Imagerie biomédicale	Gif-sur-Yvette
Biothérapies	PEPR BBTI, PEPR Biothérapies, Biothérapies et Bioproduction de Thérapies Innovantes		Bioproduction Thérapies géniques Thérapies cellulaires Thérapies tissulaires
CAD	Collecteur Analyseur de Données			Bruyères-le-Châtel
CALIS	Infrastructure Nationale de Recherche Consommateur-ALIment-Santé		Agronomie Alimentation Santé	Rennes
CCMA	Centre Commun de Microscopie Appliquée	Plateforme d'acquisition		Nice
CESCO	Centre d'Écologie et des Sciences de la Conservation, UMR 7204			Paris Brunoy Concarneau
CID	Cochin Image Database	Outils de gestion des données	Imagerie Cytométrie Protéomique	Paris
CNRGV	Centre National de Ressources Génomiques Végétales, UR 1258	Plateforme d'acquisition	Génomique végétale	Castanet Tolosan
CNRS Biologie	Institut des sciences biologiques du CNRS, CNRS-INSB			Paris
Celphedia	Création Elevage PHénotypage Distribution et Archivage d’organismes modèles			Illkirch-Graffenstaden
ChemBioFrance	Plateforme de découverte de molécules bioactives pour comprendre et soigner le vivant; Infrastructure de recherche « des petites molécules pour comprendre et soigner le vivant »			Montpellier Illkirch-Graffenstaden
Chronobiotron	UAR 3415	Plateforme d'acquisition		Strasbourg
Cid.curie.fr	Curie Image Database,iManage, OpenImadis	Entrepôt de données	Imagerie médicale Algorithme d'analyse Microscopie électronique	Paris
Cirad Dataverse	Entrepôt de données de recherche du Cirad	Entrepôt de données	Agriculture Alimentation Environnement Gestion des territoires	Montpellier
Data INRAE	Portail Data INRAE, Portail des données Inrae, Espace institutionnel de données INRAE	Entrepôt de données	Écologie Science appliquée des végétaux et des animaux Science des aliments Métadonnées DataCite Dataverse Espace institutionnel Citation	Versailles
DataSuds	Des données ouvertes pour une science durable au Sud, Dataverse IRD	Entrepôt de données	Sciences environnementales Sciences sociales Sciences biologiques Santé DOI Dataverse	Marseille
Dinamis	Dispositif Institutionnel National d’Approvisionnement Mutualisé en Imagerie Satellitaire	Plateforme d'accès	Imagerie satellitaire	Montpellier
DyNAFOR	Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, UMR 1201		Écologie des paysages Géographie sociale Télédétection Biologie de la conservation Agronomie	Auzeville
ECCOREV	Ecosystèmes continentaux et risques environnementaux, FR 3098
ECELLFrance	Plateforme nationale pour la médecine régénératrice basée sur les cellules souches mesenchymateuses adultes,ECELL FRANCE			Montpellier
EMBRC ERIC	European Marine Biological Resource Centre			Paris
EMBRC France	Centre National de ressources biologiques marines, UAR 2209			Paris Banyuls-sur-Mer Roscoff Villefranche-sur-Mer
EMERG'IN	Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l’exploration in vivo			Nouzilly
EMPHASIS	European Infrastructure for Multi-scale Plant Phenomics and Simulation			Jülich (Allemagne) Montpellier
EPGV	Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux, US 1279	Plateforme d'acquisition	Séquençage Génotypage haut débit Polymorphisme des génomes	Evry
ESE	Écologie, Systématique et Évolution, UMR 8079			Paris
ESTHER database	ESTerases and alpha/beta-Hydrolase Enzymes and Relatives	Entrepôt de données	Hydrolases alpha/beta-Hydrolase fold Esterases Cholinestérases Acétylcholinestérase Bioinformatique Homme Souris Relation structure fonction Résidus site actif Mutation génétique Maladies Résistance insecticide	Montpellier
EU-IBISBA	European Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator			Toulouse
EcogenO	Plateforme d'Éco-Génomique Ecogeno	Plateforme d'acquisition	Plateforme de Génomique environnementale	Rennes
Ecotron Européen de Montpellier	Ecotron de Montpellier, UAR 3248	Plateforme d'acquisition		Montferrier-sur-Lez
FEMTO-ST	Institut Franche-Comté Electronique Mécanique Thermique et Optique – Sciences et Technologies, UMR 6174		Micro et nano-acoustique Micro-nano-optique Microrobotique Sillicium MOEMS	Besançon
FairCarboN	PEPR FairCarboN, Carbone et Écosystèmes continentaux - leviers et trajectoires pour la neutralité carbone		Changement climatique Modèles numériques Biogéochimie Neutralité climatique Empreinte carbone
FooSIN	Projet FooSIN - Participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network	Outils de gestion des données	Principes FAIR Ressources sémantiques Ontologies Thésaurus Agriculture Agroalimentaire	Paris
GDEC	Génétique Diversité et Écophysiologie des Céréales, UMR 1095		Blé tendre Génomique et génétique des céréales	Clermont-Ferrand
Geoflow INRAE		Outils de gestion des données	Workflow Données FAIR	Paris
Geosur	Centre de données et de services de l'OSU-Réunion	Plateforme d'accès	Observation atmosphère Pacifique Sud Lidar	Saint-Denis de La Réunion
GnpIS	Genetic and Genomic Information System	Entrepôt de données	Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences Cartographie Génomique comparative	Versailles
Génomique Métabolique	GM Génomique Métabolique, UMR 8030
Géoportail	Portail national de la connaissance du territoire	Plateforme d'accès	Infrastructure nationale d'information géographique Géomatique Environnement Aménagement du territoire Biodiversité Surfaces et Interfaces continentales	Saint Mandé
IBISBA France	Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Acceleration, IBISBA FR			Ramonville Saint-Agne
IMAG'IC	Plateforme d'imagerie photonique de l'Institut Cochin	Plateforme d'acquisition	Imagerie moléculaire et cellulaire Imagerie tissulaire Imagerie intravitale	Paris
IMBE	Institut Méditerranéen de la Biodiversité et d’Écologie marine et continentale, UMR 7263			Marseille
IMEV	Institut de la Mer de Villefranche, CDS-IS-IMEV, ex Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer, FR 3761		Océan et environnement Système Terre et environnement	Villefranche-sur-Mer
IN-Sylva France	Infrastructure Nationale de recherche pour la gestion adaptative des forêts			Champenoux
INFRAFRONTIER	European Research Infrastructure for the generation, phenotyping, archiving and distribution of mouse disease models			Munich (Allemagne)
INGESTEM	Infrastructure nationale des cellules souches pluripotentes et ingénierie tissulaire			Villejuif
INRAE Genomics	INRAE Infrastructure de recherche distribuée en Génomique	Plateforme d'acquisition	Séquençage de génomes de novo Polymorphisme génétique Expression Régulation de l’expression Métagénomique.	Clermont-Ferrand Toulouse Castanet Tolosan Evry Cestas
INRAE-DipSO	Direction pour la science ouverte INRAE		Science ouverte	Paris
IPHC	Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR 7178			Strasbourg
IPS2	Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay, UMR 9213			Orsay
IntelEspace	Plateforme géomatique Intelespace	Plateforme d'acquisition	Géomatique Cartographie Archéologie Géosciences Agriculture	Clermont-Ferrand
LAE	Laboratoire Agronomie et Environnement, UMR 1121			Vandoeuvre-les-Nancy Colmar
LBM (UMR 5200)	Laboratoire de Biogenèse Membranaire, UMR 5200		Biotechnologie Biologie moléculaire Lipides Dynamique membranaire	Villenave d'Ornon
LBTI	Laboratoire de Biologie Tissulaire et d’Ingénierie thérapeutique, UMR 5305		Peau Tissu cutané Cicatrisation Ciblage de molécules thérapeutiques Réparation tissulaire Recherche OstéoArticulaire et Dentaire Vecteurs colloïdaux	Lyon
LEEISA	Laboratoire écologie évolution interactions des systèmes amazoniens, UAR 3456, USR 3456			Cayenne Guyane fançaise
LPE	Laboratoire Phénotypage-Endocrinologie	Plateforme d'acquisition	Physiologie Reproduction des animaux Hormone	Nouzilly
LiPh@SAS	Livestock Phenotyping for Sustainable Agricultural Systems, LiPh4SAS		Alimentation Santé	Paris
MERMeX	Marine Ecosystems Response in the Mediterranean Experiment	Entrepôt de données	Bassin méditerranéen Écosystème marin Biodiversité Changement climatique Modélisation	Toulouse
MICA	Microscopie Imagerie Cytométrie Azur	Plateforme d'acquisition	Microscopie électronique Microscopie à force atomique Microscopie de fluorescence Microscopie confocale Super-résolution PALM STED TIRF FLIM Microscopie à feuille de lumière Cytométrie en flux Cytométrie spectrale Tri cellulaire Imagerie du plancton Taxonomie du plancton Analyse d’images quantitative	Villefranche sur Mer Nice Biot Valbonne
MIO	Institut Méditerranéen d'Océanologie, UMR 7294, UM 110, UMR D 235			Marseille
MIRRI	Microbial Ressource Research Infrastructure			Braga (Portugal)
MetaboHUB	Infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l’innovation, à la formation et au transfert de technologie			Villenave d'Ornon
O3HP	Oak Observatory at OHP, Observatoire du chêne pubescent	Plateforme d'acquisition	Biodiversité Forêt méditerranéenne Changements climatiques Chênes pubescents	Saint Michel l'Observatoire
ODK INRAE	OpenDataKit INRAE	Outils de gestion des données	Sciences participatives	Paris
OENO	Unité de recherche œnologie, EA 4577, UMR 1366		Vin Microorganismes	Villenave d’Ornon
ORDaR	OTELo Research Data Repository	Entrepôt de données		Vandoeuvre-les-Nancy
OSUR	Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes, OSU OSUR		Système Terre et environnement	Rennes
OTELo	Observatoire Terre et Environnement Lorraine, OSU OTELo			Vandoeuvre-les-Nancy
OpenImadis	iManage Strandls, curie Image Data Management	Outils de gestion des données	Imagerie médicale Gestion de données Visualisation Annotation	Paris Nantes
PAM	Plateforme d'Analyse du Mouvement	Plateforme d'acquisition	Biomécanique Cinématique Cinétique Electrophysiologie Oculométrie Motion Capture Analyse du Mouvement Humain Motricité	Bordeaux
PGT	Pre industrial Gene Therapy consortium, Consortium Préindustriel des vecteurs de Thérapie Génique
PGTB	Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux	Plateforme d'acquisition	Génomique Séquençage Génotypage Biodiversité Metabarcoding Longs-reads Bioanalyse	Cestas
PHENOMIN	French National Infrastructure for Mouse Phenogenomics		Phénogénomique
PHENOMIN-CIPHE	Centre d’Immunophénomique,CIPHE, UMS 3367, US 12	Plateforme d'acquisition		Marseille
PHENOMIN-ICS	Institut Clinique de la Souris, ICS	Plateforme d'acquisition		Illkirch-Graffenstaden
PHENOMIN-TAAM	Typage et Archivage d'Animaux Modèles, TAAM, UAR 44	Plateforme d'acquisition		Orléans
PIC	Plateau d'Imagerie Cellulaire	Plateforme d'acquisition	Microscopie photonique Biologie de la reproduction Neurobiologie	Nouzilly
PIV	Plateforme Imageries du Vivant de l’Institut Cochin	Plateforme d'acquisition	Explorations physiologiques & fonctionnelles Imagerie in vivo Recherche pré-clinique	Paris
PIXANIM	Phénotypage par Imagerie in et ex vivo de l'Animal à la Molécule	Plateforme d'acquisition	Phénotypage Métabolomique Exploration fonctionnelle IRM	Nouzilly
PPanGGOLiN	Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors	Outils de gestion des données	Logiciel Pangénomique Génomique comparative	Evry
PRC	Physiologie de la reproduction et des comportements, UMR 7247, UMR 0085		Neuroendocrinologie Biologie du comportement Biologie de la reproduction Biologie systémique et de la modélisation	Nouzilly
Phenome-Emphasis France	Infrastructure Francaise de Phenomique Végétale, European Infrastructure for multi-scale Plant Phenomics and Simulation for food security in a changing climate France			Montpellier
PlantBioInfoPF	Plant Bioinformatics Facility, Plateforme de bioinformatique des plantes	Plateforme de calcul	Plateforme de bioinformatique	Versailles
Plateformes Lilloises en Biologie et Santé	PLBS, UMS 2014, US41
Puéchabon	Site expérimental de Puéchabon	Plateforme d'acquisition	Écosystème forestier méditerranéen Changements climatiques Biodiversité	Puéchabon
RARe	Ressources Agronomiques pour la Recherche			Jouy-en-Josas
RECOVER	Risques ECOsystèmes Vulnérabilité Environnement Résilience, UMR 1467			Le Tholonet
SAS	Sol Agro et hydrosystème Spatialisation, UMR SAS			Rennes Quimper
SFR Biosciences	UAR 3444,US 8, 851
SFR Santé Lyon Est	Fédération de Recherche Louis Léopold Ollier, UAR 3453, US 7			Lyon
SILABE	Simian Laboratory Europe	Plateforme d'acquisition	Primates non-humains	Niederhausbergen
SPlotOpen		Plateforme d'accès	Biodiversité Communautés végétales terrestres Changements globaux Changements climatiques Écologie	Leipzig (Allemagne)
SVA	PEPR SVA, Sélection Végétale Avancée		Édition des génomes Génomique
SYGADE		Plateforme d'accès	Entretien	Paris
Science ouverte INRAE	Gestion et partage des données scientifiques	Information	Identifiants pérennes Plan de gestion de données Supports de formation Tutoriels Ontologies Zenodo INRAE Principes FAIR Science ouverte Bonnes pratiques Agronomie Agriculture Alimentation Environnement	Paris
TEFOR	Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles			Illkirch
TEFOR Fly Facility		Plateforme d'acquisition	Drosophile Ingénierie génétique Phénotypage	Clermont-Ferrand
TEFOR Paris Saclay	Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS	Plateforme d'acquisition	Poisson zèbre Autres poissons modèles Modèles aquatiques Zootechnie Production de lignées d'intérêt Imagerie Reconstitution 3D Gestion de données Édition du génome	Saclay
TEFOR-TACGENE		Plateforme d'acquisition		Paris
TETIS	UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470		Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale	Montpellier
TETIS : Plateformes de données	Plateformes de données de UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470	Entrepôt de données	Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale	Montpellier
TRIP	Transgenic Rats Immunophenomic Platform, Transgenèse Rat et Immunophénomique	Plateforme d'acquisition		Nantes
Tela Botanica	Réseau des botanistes francophones, Réseau Tela Botanica	Plateforme d'accès	Botanique Sciences participatives	Montpellier
Théia Animation régionale	Theia réseau Animation régionale ART, Animation régionale Theia (ART)	Accompagnement	Télédétection Observation spatiale Surfaces et Interfaces continentales
URGI	Unité de Recherche Génomique-Info, UR 1164
WheatIS	Wheat@URGI,	Plateforme d'accès	Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences	Versailles
e-RECOLNAT	Portail du réseau des collections naturalistes françaises e-ReColNat	Plateforme d'accès	Botanique Zoologie Paléontologie Biodiversité Géodiversité Collections naturalistes Herbier Interopérabilité Darwin Core	Paris

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