EcogenO

De Cat OPIDoR
Aller à la navigation Aller à la recherche
EcogenO
EcogenO.png
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Plateforme d'Éco-Génomique Ecogeno
URL https://ecogeno.univ-rennes1.fr/
Contact ecogeno@listes.univ-rennes1.fr
Localisation Rennes
Structure d'appartenance OSUR, AnaEE-France
Tutelles Université de Rennes 1, CNRS


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


Chargement de la carte...
48° 7' 5.56" N, 1° 38' 17.88" W



La plateforme EcogenO, spécialisée dans la génomique environnementale, permet de réaliser des projets de production d’amplicons à grande échelle et leur analyse par séquençage, des projets de RNASeq ou encore DNASeq.

Dotée de séquenceurs NGS de 2ème génération (Miseq d'Illumina et DNBSEQ-G400 de MGI) et d'un grand nombre d'équipements satellites nécessaires à la préparation des échantillons, la plate-forme EcogenO propose la réalisation et l’accompagnement de projets de séquençage, de la préparation des librairies jusqu’à l’analyse primaire bio-informatique des données.

Un équipement de PCR quantitative et de génotypage très haut débit, (Smartchip system, Takara), offre à la communauté scientifique une capacité de conduite de projet pour des analyses fonctionnelles (qPCR et RT-qPCR) et de génotypage SNP.


Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de Génomique environnementale

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage : Formulaire pour soumettre un projet

Modèle économique :

Certification/Label :IBISA (https://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

EcogenO est en lien avec les services et structures

France Génomique



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
AnaEE-FranceSETE
Station des Nouragues
Ecotron Ile de France
Ecotron Européen de Montpellier
PLANAQUA
EcogenO
AnaEE-France Metadata Catalog
AnaEE-France entrepôt
Jardin du Lautaret
EDNA
O3HP
Puéchabon
OSUROSURIS
H+
AGRHYS
EcogenO