EPGV

EPGV

Autres noms	Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux, US 1279
URL	https://epgv.versailles-grignon.hub.inrae.fr
Tutelles	INRAE
Identifiants
RNSR	200517800F
Localisation	Evry

Service

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
URL	https://epgv.versailles-grignon.hub.inrae.fr
Contact	https://epgv.versailles-grignon.hub.inrae.fr/contact, support-epgv@inrae.fr
Structure d'appartenance	EPGV, INRAE Genomics

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Collecte

Analyse

Documentation

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L'unité INRAE EPGV, Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux US1279, est intégrée sur le site des 2 grands centres nationaux de séquençage et de génotypage, le GENOSCOPE et le CNRGH, composants actuels de l'Institut de biologie François Jacob (IbFJ) du CEA situés à Evry pour :

• Développer des protocoles adaptés aux spécificités des espèces végétales (taille des génomes, autogamie, allogamie, large variabilité génétique, polyploïdie,…) en fonction des évolutions technologiques disponibles sur les plateformes du GENOSCOPE et du CNRGH
• Mettre à la disposition de différentes équipes (INRAE, CIRAD,…) des outils de séquençage et de génotypage à haut débit afin de répondre aux besoins de leurs programmes scientifiques
• Etablir en collaboration avec les bio-informaticiens les processus et les outils pour l'analyse et la gestion des données de polymorphisme
• Participer au réseau des différentes plateformes de génomique et plus particulièrement de l'infrastructure nationale "France Génomique" dont l’EPGV est partenaire. L'EPGV est également l'un des 4 partenaires de l'infrastructure de Recherche INRAE Genomics.

Avec 2 équipes Développement Technologique & Production et Informatique & Bio-Informatique, l'unité EPGV répond aux besoins des projets en génomique végétale et environnementale pour l’étude de polymorphismes nucléotidiques ponctuels (SNP) et de structure (SV). EPGV assure une veille scientifique et technologique et offre aux partenaires scientifiques, expertise, maîtrise et réalisation en s’adaptant aux évolutions technologiques.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

• Séquençage
• Génotypage haut débit
• Polymorphisme des génomes

Type de données :Génomique

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

EPGV est en lien avec les services et structures

Genoscope, CNRGH, GeT, PGTB, CNRGV, Gentyane

Offre de services de EPGV

• EPGV (Plateforme d'acquisition)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EPGV	EPGV
INRAE Genomics	GeT Gentyane EPGV PGTB CNRGV INRAE Genomics