IFB

IFB

Autres noms	Institut Français de Bioinformatique, ELIXIR France
URL	http://www.france-bioinformatique.fr/
Tutelles	CNRS, CEA, INRAE, INRIA, INSERM
Identifiant dans un autre catalogue	https://appliweb.dgri.education.fr/rnsr/PresenteStruct.jsp?numNatStruct=201321719F&PUBLIC=OK (RNSR)

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L’Institut Français de Bioinformatique, IFB, est une infrastructure nationale de service en bioinformatique. Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. L'IFB fédère les services et les ressources de 31 plateformes en bioinformatique dont l'IFB-core. Ces services consistent à :

• Fournir un accès à des bases de données spécialisées à haute valeur ajoutée issues de l’expertise scientifique du laboratoire d’accueil de la plateforme
• Mettre à disposition des outils et des services en ligne correspondant aux domaines d’expertise du laboratoire d’accueil de la plateforme
• Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à la gestion et l’analyse des données des sciences du vivant
• Fournir un appui aux projets scientifiques de la communauté des sciences du vivant et assurer leur hébergement sur une infrastructure informatique adaptée
• Offrir des formations en bioinformatique

L’accès aux données produites par l’infrastructure IFB est restreint : les données restent accessibles uniquement aux propriétaires et aux collaborateurs avant publication des résultats.

L'IFB est le noeud français, ELIXIR-FR de l’infrastructure de recherche européenne d’ELIXIR.

L'IFB a développé, en coopération avec MetaboHUB, Workflow4Metabolomics, W4M, portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

Offre de services de IFB

• VirHostNet (Entrepôt de données)
• FAIR-Checker (Outils de gestion des données)
• W4M (Outils de gestion des données)
• Orphanet (Plateforme d'accès)
• ABiMS (Plateforme de calcul)
• ARTbio (Plateforme de calcul)
• ATGC (Plateforme de calcul)
• AuBI (Plateforme de calcul)
• BiGEst (Plateforme de calcul)
• BiGR (Plateforme de calcul)
• Bilille (Plateforme de calcul)
• CBiB (Plateforme de calcul)
• DAC (Plateforme de calcul)
• GenOuest (Plateforme de calcul)
• GenoToul Bioinfo (Plateforme de calcul)
• iCONICS (Plateforme de calcul)
• MBI-DS4H (Plateforme de calcul)
• MicroScope (Plateforme de calcul)
• Migale (Plateforme de calcul)
• P3M (Plateforme de calcul)
• PACA BioInfo (Plateforme de calcul)
• PRABI Lyon-Gerland (Plateforme de calcul)
• Pasteur HUB (Plateforme de calcul)
• PlantBioInfoPF (Plateforme de calcul)
• RPBS (Plateforme de calcul)
• South Green (Plateforme de calcul)

IFB est en lien avec les services et structures

France Grilles, IDRIS, France Génomique, CCRT, MetaboHUB, CAD, CINES, CC-IN2P3, IPHC, Inist-CNRS, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques, MGP, CRefIX

Portée internationale de IFB

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/), ESFRI Landmark (https://www.esfri.eu/)

Centre National de la Recherche Scientifique