Pasteur HUB

De Cat OPIDoR
Pasteur HUB
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Bioinformatics and Biostatistics HUB, Plateforme de bioinformatique de l'Institut Pasteur
URL https://research.pasteur.fr/fr/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub
Contact bioinfo@pasteur.fr

bionfo-ask@pasteur.fr

Localisation Paris
Structure d'appartenance IFB
Tutelles Institut Pasteur, CNRS


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La plateforme de bio-informatique de l’Institut Pasteur associe le Centre d’Informatique pour la Biologie (CIB) et la plateforme de Bioanalyse Génomique (PFBaG). Ses missions incluent la mise à disposition d’outils et d’expertise bio-informatiques, et un accompagnement à l’interprétation biologique des données générées par les projets de recherche en génomique. Le CIB propose de nombreuses ressources bio-informatiques et prend en charge les volets informatiques des nouveaux développements, tandis que PFBaG fournit une expertise bio-informatique et propose des stratégies d’analyse originales. En interaction étroite avec les plates-formes « humides » de la Genopole Pasteur, la plateforme propose ses compétences pour la plupart des applications liées au séquençage à haut débit (recherche de variants, identification d’agents infectieux, analyses RNA-Seq et ChIP-Seq, etc.).


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage : accès restreint aux membres de l'Institut Pasteur sauf via les services web (galaxy.pasteur.fr par ex)

Modèle économique :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

Pasteur HUB est en lien avec les services et structures

France Génomique, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques

Portée internationale de Pasteur HUB

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
VirHostNet
ARTbio
DAC
FAIR-Checker