ARTbio

De Cat OPIDoR
ARTbio
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Bioinformatics analyses platform
URL https://www.artbio.fr/
Contact artbio@listes.upmc.fr
Localisation Paris
Structure d'appartenance IBPS, IFB
Tutelles CNRS, Sorbonne Université


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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ARTbio est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil Galaxy, une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de logiciels d’analyses de données. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. L’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses.

Cet objectif est abordé à travers 3 axes:

  • Services (services d'analyse ou de projets collaboratifs, services web en ligne)
  • Enseignement (accompagnement, journées de formation, séminaires, documentation)
  • Développement (outils, workflows, environnements d'analyse, stockage, etc)


L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse.


Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé


PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique
  • Génomique
  • Logiciel
  • Analyse à grande échelle
  • Séquençage

Type de données :Données computationnelles

Communauté d'utilisateurs : Communautés académique et privée Usagers et bénéficiaires :Biologistes, Médécins


Conditions d'usage : Création de compte

Modèle économique :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

ARTbio est en lien avec les services et structures

Inserm, France Génomique



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IBPSARTbio
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
VirHostNet
ARTbio
DAC
FAIR-Checker