Pasteur HUB

  Pasteur HUB

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Bioinformatics and Biostatistics HUB, Plateforme de bioinformatique de l'Institut Pasteur
URL	https://research.pasteur.fr/fr/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub
Contact	bioinfo@pasteur.fr bionfo-ask@pasteur.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IFB
Tutelles	Institut Pasteur, CNRS

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

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La plateforme de bio-informatique de l’Institut Pasteur associe le Centre d’Informatique pour la Biologie (CIB) et la plateforme de Bioanalyse Génomique (PFBaG). Ses missions incluent la mise à disposition d’outils et d’expertise bio-informatiques, et un accompagnement à l’interprétation biologique des données générées par les projets de recherche en génomique. Le CIB propose de nombreuses ressources bio-informatiques et prend en charge les volets informatiques des nouveaux développements, tandis que PFBaG fournit une expertise bio-informatique et propose des stratégies d’analyse originales. En interaction étroite avec les plates-formes « humides » de la Genopole Pasteur, la plateforme propose ses compétences pour la plupart des applications liées au séquençage à haut débit (recherche de variants, identification d’agents infectieux, analyses RNA-Seq et ChIP-Seq, etc.).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : accès restreint aux membres de l'Institut Pasteur sauf via les services web (galaxy.pasteur.fr par ex)

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

Pasteur HUB est en lien avec les services et structures

France Génomique, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques

Portée internationale de Pasteur HUB

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB
Institut Pasteur	CeRIS Institut Pasteur : Plateforme de Data management Institut Pasteur : Entrepôt ShareLoc.XYZ Pasteur HUB

Centre National de la Recherche Scientifique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.