PRABI Lyon-Gerland

  PRABI Lyon-Gerland

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Pôle Rhônes-Alpes de Bioinformatique, PRABI site de Lyon-Gerland, Pôle Bio-Informatique Lyonnais, PBIL
URL	https://prabi.ibcp.fr/
Contact	gilbert.deleage@ibcp.fr, raphael.terreux@ibcp.fr
Localisation	Lyon
Structure d'appartenance	IFB, LBTI
Tutelles	CNRS, Université Claude Bernard Lyon 1

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Conservation

Exposition

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PRABI Lyon-Gerland localisé à l'Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP), est une plateforme de bioinformatique spécialisée dans l’analyse des données génomiques, transcriptomiques et métagénomiques, avec une prise en compte forte des aspects écologiques et évolutifs.

Le PRABI-Gerland développe :

• Différentes méthodes dédiées à la prédiction de structures secondaires des protéines
• Des outils de détection de motifs flous dans les séquences protéiques
• Des outils de modélisation automatique de structures 3D de protéines [Geno3D]
• Un logiciel d’analyse de séquences protéiques (sous Windows) (ANTHEPROT)
• Un service web intégré (NPS@)
• Un algorithme de recherche de similarité de sites 3D dans les structures de protéines (SuMo)

les bases de données dans le domaine infectieux, les méthodes de prédiction et d'optimisation des structures 3D de protéines ainsi que les outils et services s'y rapportant. Dans le domaine des services la spécificité de la plateforme est la bioinformatique structurale (Modélisation moléculaire, prédiction de structure).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Bioinformatique structurale
• Prédiction de structure
• Base de données structurales
• Analyse de séquences
• Modélisation moléculaire
• Docking moléculaire

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :RIO (?)

IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

PRABI Lyon-Gerland est en lien avec les services et structures

France Génomique, FRISBI, CNRS Biologie, IBCP

Portée internationale de PRABI Lyon-Gerland

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB
LBTI	PRABI Lyon-Gerland

Centre National de la Recherche Scientifique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.