GenOuest

  GenOuest

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme GenOuest, Plateforme de bio-informatique de Rennes, GenOuest bioinformatics, UMR 6074
URL	https://www.genouest.org/
Contact	https://www.genouest.org/contact/
Localisation	Rennes
Structure d'appartenance	IFB, IRISA
Tutelles	CNRS, Inria, Université de Rennes

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

Conservation

Exposition

Chargement de la carte...

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La plate-forme GenOuest offre l'accès à un environnement bio-informatique complet combinant :

• une infrastructure bioinformatique matérielle et logicielle (reposant sur un cluster et un cloud);
• le développement d’applications bioinformatiques (environnements, interfaces, bases de données publiques, outils et chaînes de traitements,…) ;
• une expertise et une consultance (les scientifiques peuvent bénéficier d’une expertise pour l’analyse de leurs données ou pour l’élaboration de stratégies d’analyse bioinformatiques) ;
• des formations ;
• de l’hébergement scientifique (les utilisateurs peuvent mettre en place de nouvelles ressources et/ou valoriser leurs travaux scientifiques grâce à la mise en place de sites ou applications web).

Cet environnement de calcul est exploitable de diverses façons : cluster, cloud privé, portail web. La plateforme s’intéresse particulièrement aux nouvelles modalités de calcul (virtualisation, cloud computing, portails de calcul) ainsi qu’à la gestion des données et des métadonnées en Biologie.

Grâce au projet CeSGO, GenOuest propose un ensemble d'outils collaboratifs pour gérer au mieux les projets et données scientifiques. GenOuest assure également le transfert technologique des nouveaux outils issus de la recherche en bio- informatique de l'Institut dont elle dépend.

Plateforme CNRS Sciences informatiques qui est un site d'implantation de l'Institut Francais de Bioinformatique

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Développement logiciel
• Analyse de données
• Gestion de données
• Base de données
• Calcul scientifique
• Bioinformatique
• Cloud computing
• e-infrastructure
• Environnement Virtuel de Recherche
• Formation

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : Pour accéder aux services proposés par la plateforme il est nécessaire d'ouvrir un compte. La demande de compte s'effectue en ligne sur le site de GenOuest

Conditions tarifaires : L'ouverture de compte est gratuite pour le moment

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

CNOC INRAE (http://wiki.inra.fr/wiki/prodinra/Indexation/Mentionner+Plateformes+INRA)

Conditions générales d'utilisation :

GenOuest est en lien avec les services et structures

France Génomique, MetaboHUB, Biogenouest, GenScale

Portée internationale de GenOuest

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB
IRISA	GenOuest

Unité Mixte de Recherche

Centre National de la Recherche Scientifique

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.