IFB
| Autres noms | Institut Français de Bioinformatique, ELIXIR France, IFB core Institut français de bioinformatique, UMS 3601 |
|---|---|
| URL | http://www.france-bioinformatique.fr/ |
| Tutelles | CNRS, CEA, INRAE, INRIA, INSERM |
| Identifiants | |
| RNSR | 201321719F |
| Infrastructure nationale |  IR
|
| Noeud français | ELIXIR |
| Type d'infrastructure | Distribuée |
L’Institut Français de Bioinformatique, IFB, est une infrastructure nationale de service en bioinformatique (calcul, stockage, outils, bases de données, accompagnements de projets, formations). Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. L'IFB fédère les services et les ressources de 31 plateformes en bioinformatique dont l'IFB-core. Ces services consistent à :
- Fournir un accès à des bases de données spécialisées à haute valeur ajoutée issues de l’expertise scientifique du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition des outils et des services en ligne correspondant aux domaines d’expertise du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à la gestion et l’analyse des données des sciences du vivant
- Fournir un appui aux projets scientifiques de la communauté des sciences du vivant et assurer leur hébergement sur une infrastructure informatique adaptée
- Offrir des formations en bioinformatique
L’accès aux données produites par l’infrastructure IFB est restreint : les données restent accessibles uniquement aux propriétaires et aux collaborateurs avant publication des résultats.
L'IFB est le noeud français, ELIXIR-FR de l’infrastructure de recherche européenne d’ELIXIR.
L'IFB a développé, en coopération avec MetaboHUB, Workflow4Metabolomics, W4M, portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.
Domaines scientifiques :
Vie & Santé
Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ».
Thématique et/ou mots clés :- Bioinformatique
Offre de services de IFB
- VirHostNet (Entrepôt de données)
- FAIR-Checker (Outils de gestion des données)
- W4M (Outils de gestion des données)
- Orphanet (Plateforme d'accès)
- ABiMS (Plateforme de calcul)
- ARTbio (Plateforme de calcul)
- ATGC (Plateforme de calcul)
- AuBI (Plateforme de calcul)
- BiGEst (Plateforme de calcul)
- BiGR (Plateforme de calcul)
- Bilille (Plateforme de calcul)
- CBiB (Plateforme de calcul)
- DAC (Plateforme de calcul)
- GenOuest (Plateforme de calcul)
- GenoToul Bioinfo (Plateforme de calcul)
- iCONICS (Plateforme de calcul)
- MBI-DS4H (Plateforme de calcul)
- MicroScope (Plateforme de calcul)
- Migale (Plateforme de calcul)
- P3M (Plateforme de calcul)
- PACA BioInfo (Plateforme de calcul)
- PRABI Lyon-Gerland (Plateforme de calcul)
- Pasteur HUB (Plateforme de calcul)
- PlantBioInfoPF (Plateforme de calcul)
- RPBS (Plateforme de calcul)
- South Green (Plateforme de calcul)
IFB est en lien avec les services et structures
France Grilles, IDRIS, France Génomique, CCRT, MetaboHUB, CINES, CC-IN2P3, FMG2025/CAD et CREFIX, MetaGenoPolis, IPHC, Inist-CNRS, CNRS-INSB, CNRS-INS2I
Portée internationale de IFB
ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)
ESFRI Landmark (http://www.esfri.eu/)