« GenOuest » : différence entre les versions
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Version du 2 avril 2021 à 10:59
| Type de service | Plateforme de calcul |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Plateforme GenOuest, Plateforme de bio-informatique de Rennes, GenOuest bioinformatics, UMR 6074 |
| URL | https://www.genouest.org/ |
| Contact | https://www.genouest.org/contact/ |
| Localisation | Rennes |
| Structure d'appartenance | IFB |
| Tutelles | CNRS-INS2I, INRIA, Université de Rennes 1, IRISA |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
- une infrastructure bioinformatique matérielle et logicielle (reposant sur un cluster et un cloud);
- le développement d’applications bioinformatiques (environnements, interfaces, bases de données publiques, outils et chaînes de traitements,…) ;
- une expertise et une consultance (les scientifiques peuvent bénéficier d’une expertise pour l’analyse de leurs données ou pour l’élaboration de stratégies d’analyse bioinformatiques) ;
- des formations ;
- de l’hébergement scientifique (les utilisateurs peuvent mettre en place de nouvelles ressources et/ou valoriser leurs travaux scientifiques grâce à la mise en place de sites ou applications web).
Cet environnement de calcul est exploitable de diverses façons : cluster, cloud privé, portail web. La plateforme s’intéresse particulièrement aux nouvelles modalités de calcul (virtualisation, cloud computing, portails de calcul) ainsi qu’à la gestion des données et des métadonnées en Biologie.
Grâce au projet CeSGO, GenOuest propose un ensemble d'outils collaboratifs pour gérer au mieux les projets et données scientifiques. GenOuest assure également le transfert technologique des nouveaux outils issus de la recherche en bio- informatique de l'Institut dont elle dépend.
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
Sciences informatiques et informatique« Sciences informatiques et informatique » n’est pas dans la liste (PE1 Mathématiques, PE2 Constituants fondamentaux de la matière, PE3 Physique de la matière condensée, PE4 Chimie physique et analytique, PE5 Chimie de synthèse et matériaux, PE6 Sciences informatiques et informatique, PE7 Ingénierie des systèmes et de la communication, PE8 Ingénierie des produits et des procédés, PE9 Sciences de l'Univers, PE10 Sciences du Système Terre, ...) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Sciences & Technologies ».
Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire« Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ».; Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ».
Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
- développement logiciel
- analyse de données
- gestion de données
- bases de données
- calcul scientifique
- bioinformatique
- Cloud computing
- e-infrastructure
- Environnement Virtuel de Recherche
- formation
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage : Pour accéder aux services proposés par la plateforme il est nécessaire d'ouvrir un compte. La demande de compte s'effectue en ligne sur le site de GenOuest
Conditions tarifaires : L'ouverture de compte est gratuite pour le moment
Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)
ISO 9001 (https://www.genouest.org/iso9001/)
CNOC INRAE (http://wiki.inra.fr/wiki/prodinra/Indexation/Mentionner+Plateformes+INRA)
Conditions générales d'utilisation :
GenOuest est en lien avec les services et structures
France Génomique, MetaboHUB, Biogenouest, GenScale
Portée internationale de GenOuest
ELIXIR (https://elixir-europe.org/)