AuBI

AuBI

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Auvergne BioInformatique
URL	https://mesocentre.uca.fr/projets-associes/plateforme-aubi/plateforme-aubi-70146.kjsp
Contact	support.dsi@uca.fr, nadia.goue@uca.fr, pierre.peyret@uca.fr
Localisation	Aubière
Structure d'appartenance	IFB
Tutelles	Université Clermont Auvergne, CNRS, INRAE

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Conservation

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La plateforme Auvergne BioInformatique, AuBI, rassemble les ressources bioinformatiques du site auvergnat, et s'appuie sur les ressources en calcul et en stockage du Mésocentre Clermont-Auvergne. Elle est associée à l'Institut Français de Bioinformatique ainsi qu'à la plateforme du PRABI .

Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par BioMAJ. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy.

La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface BioMAJWatcher.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

AuBI est en lien avec les services et structures

France Génomique, Mésocentre Clermont Auvergne, CNRS-INSB, CNRS-INEE

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale VirHostNet ARTbio DAC FAIR-Checker
Université Clermont Auvergne	Mésocentre Clermont Auvergne AuBI G.O.T.O.DO UCA Université Clermont Auvergne : Science ouverte Université Clermont Auvergne : Formations CEBA Cloud Environnemental

Centre National de la Recherche Scientifique