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ABiMS  est  partie  intégrante  de  la Station  Biologique  de Roscoffet    est    rattachée    au    Service    Informatique    et Bioinformatique. Elle  est intégrée à  l’Institut  Français  de  Bio-informatique (IFB)  et  à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et  l’analyse  des  données  issues  du  monde  marin  (algues,  poissons, cyanobactéries,  picoplancton...),  et  sont  en  lien  direct  avec  les  2 axes  de  recherche  de  la  Station  Biologique  que  sont  la  biologie  et l'écologie.  ABiMS  interagit  avec  les  équipes  de  recherche  dans  le cadre  de  collaborations  scientifiques  formalisées,  ou  sous  la  forme de prestations.
ABiMS  est  partie  intégrante  de  la Station  Biologique  de Roscoffet    est    rattachée    au    Service    Informatique    et Bioinformatique. Elle  est intégrée à  l’Institut  Français  de  Bio-informatique (IFB)  et  à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et  l’analyse  des  données  issues  du  monde  marin  (algues,  poissons, cyanobactéries,  picoplancton...),  et  sont  en  lien  direct  avec  les  2 axes  de  recherche  de  la  Station  Biologique  que  sont  la  biologie  et l'écologie.  ABiMS  interagit  avec  les  équipes  de  recherche  dans  le cadre  de  collaborations  scientifiques  formalisées,  ou  sous  la  forme de prestations.


Mise  à  disposition  d’une infrastructure  dédiée  au  calcul scientifique:  ressources  matérielles  (calcul  et  stockage)  et environnement de workflows(outils, portail,...)
Mise  à  disposition  d’une infrastructure  dédiée  au  calcul scientifique:  ressources  matérielles  (calcul  et  stockage)  et environnement de workflows (outils, portail...).
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
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|Thematique=Plateforme de bioinformatique
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[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]]

Dernière version du 10 novembre 2023 à 12:37

ABiMS
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science.
URL http://abims.sb-roscoff.fr
Contact support.abims@sb-roscoff.fr
Localisation Roscoff
Structure d'appartenance IFB, SBR
Tutelles CNRS, Sorbonne Université


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science, met à disposition une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows(outils, portail,...) .

ABiMS est partie intégrante de la Station Biologique de Roscoffet est rattachée au Service Informatique et Bioinformatique. Elle est intégrée à l’Institut Français de Bio-informatique (IFB) et à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et l’analyse des données issues du monde marin (algues, poissons, cyanobactéries, picoplancton...), et sont en lien direct avec les 2 axes de recherche de la Station Biologique que sont la biologie et l'écologie. ABiMS interagit avec les équipes de recherche dans le cadre de collaborations scientifiques formalisées, ou sous la forme de prestations.

Mise à disposition d’une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows (outils, portail...).


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (http://abims.sb-roscoff.fr/sites/abims.sb-roscoff.fr/files/paq.pdf)

IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

ABiMS est en lien avec les services et structures

EMBRC France, France Génomique

Portée internationale de ABiMS

EMBRC ERIC (http://www.embrc.eu/)

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
VirHostNet
ARTbio
DAC
FAIR-Checker
SBRABiMS
SulfAtlas