LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes

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Biotechnologie utilisant tous les organismes, biotechnologie pour les applications environnementales et alimentaires, sciences appliquées aux plantes et aux animaux, bioingénierie et biologie synthétique, biomasse et biocarburants, risques biologiques


A ce jour 133 entités sont référencées dans le sous-domaine LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes

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Légende :  Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche   Service   Structure

Type de service
Thématique/Mots clés
Cycle de vie des données
Label ou certification
Politique de données
      Acronyme Nom développé Type de service Thématique/Mots clés Localisation
  AFMB Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, UMR 7257 Complexes Macromoléculaires Viraux
Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire
Glycobiologie et Neurobiologie Structurales
Glycogénomique
Interactions hôte-pathogène
Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design
Marseille
  AGAP Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales, UMR 108, UMR 1334 Agrobiodiversité Montpellier
Guadeloupe
Martinique
  Adonis Acquisition de DONnéeS à l’INRAE Outils de gestion des données Saisie données d'observation
Expérimentation de terrain
Logiciel
  AgroPortal Outils de gestion des données Agroalimentaire
Agriculture
Ontologie
Ressource sémantique
Artefact sémantique
Montpellier
  AnaEE-France Metadata Catalog Plateforme d'accès Écosystèmes continentaux
  Anexplo Plateforme d'acquisition Phénotypage animal Toulouse
  AniRA plateforme régionale Ani-Rhone-Alpes Plateforme d'acquisition Lyon
  Anses Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail
  B-BEST PEPR B-BEST, Biomasses, biotechnologies et technologies durables pour la chimie et les carburants Produits biosourcés
Chimie durable
Biocarburants
Biotechnologies
Énergie
  BALISTE Base de données naturalistes partagée Outils de gestion des données Protocoles
Méthodes d'observation
Paris
  BIII BioImage Informatics Index, BISE Plateforme d'accès Bioimagerie
Analyse d'images
Nantes
  BIOBANQUES Infrastructure nationale BIOBANQUES,US 13
  BIP Bioénergétique et ingénierie des protéines, UMR 7281 Bioénergétique
Ingénierie des protéines
Marseille
    BioEmergences Dynamiques multiéchelles dans la morphogenèse, Multilevel Dynamics in Morphogenesis, FRE 2039 Plateforme d'accès Morphogenèse
Imagerie biomédicale
Gif-sur-Yvette
  Biothérapies PEPR BBTI, PEPR Biothérapies, Biothérapies et Bioproduction de Thérapies Innovantes Bioproduction
Thérapies géniques
Thérapies cellulaires
Thérapies tissulaires
  Bordeaux Sciences Agro École Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine, BSA Agronomie
Œnologie
Vin
Gradignan
    CAD Collecteur Analyseur de Données Bruyères-le-Châtel
    CALIS Infrastructure Nationale de Recherche Consommateur-ALIment-Santé Agronomie
Alimentation
Santé
Rennes
    CCMA Centre Commun de Microscopie Appliquée Plateforme d'acquisition Nice
  CESCO Centre d'Écologie et des Sciences de la Conservation, UMR 7204 Paris
Brunoy
Concarneau
  CID Cochin Image Database Entrepôt de données Imagerie
Cytométrie
Protéomique
Paris
    CNRGV Centre National de Ressources Génomiques Végétales, UR 1258 Plateforme d'acquisition Génomique végétale Castanet Tolosan
  CNRS Biologie Institut des sciences biologiques du CNRS, CNRS-INSB Paris
  CSGA Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation, UMR 1324, UMR 6265 Consommateur
Perception sensorielle
Conditions physiologiques ou physiopathologiques
Aliment
Dijon
    Celphedia Création Elevage PHénotypage Distribution et Archivage d’organismes modèles Illkirch-Graffenstaden
    ChemBioFrance Plateforme de découverte de molécules bioactives pour comprendre et soigner le vivant, Infrastructure de recherche de petites molécules pour comprendre et soigner le vivant Montpellier
Illkirch-Graffenstaden
  Chronobiotron UAR 3415 Plateforme d'acquisition Strasbourg
  Cid.curie.fr Curie Image Database,iManage, OpenImadis Entrepôt de données Imagerie médicale
Algorithme d'analyse
Microscopie électronique
Paris
  Cirad Dataverse Entrepôt de données de recherche du Cirad Entrepôt de données Agriculture
Alimentation
Environnement
Gestion des territoires
Montpellier
  Data INRAE Portail Data INRAE, Portail des données Inrae, Espace institutionnel de données INRAE Entrepôt de données Écologie
Science appliquée des végétaux et des animaux
Science des aliments
Métadonnées
DataCite
Dataverse
Espace institutionnel
Citation
Versailles
  DataSuds Des données ouvertes pour une science durable au Sud, Dataverse IRD Entrepôt de données Sciences environnementales
Sciences sociales
Sciences biologiques
Santé
DOI
Dataverse
Marseille
  Dinamis Dispositif Institutionnel National d’Approvisionnement Mutualisé en Imagerie Satellitaire Plateforme d'accès Imagerie satellitaire Montpellier
  DyNAFOR Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, UMR 1201 Écologie des paysages
Géographie sociale
Télédétection
Biologie de la conservation
Agronomie
Auzeville
  ECCOREV Ecosystèmes continentaux et risques environnementaux, FR 3098
    ECELLFrance Plateforme nationale pour la médecine régénératrice basée sur les cellules souches mesenchymateuses adultes,ECELL FRANCE Montpellier
  ECOBIOP Écologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons, UMR 1224 Écologie expérimentale
Populations piscicoles
Saint-Pee-Sur-Nivelle
  EMBRC ERIC European Marine Biological Resource Centre Paris
    EMBRC France Centre National de ressources biologiques marines, UAR 2209 Paris
Banyuls-sur-Mer
Roscoff
Villefranche-sur-Mer
    EMERG'IN Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l’exploration in vivo Nouzilly
  EMPHASIS European Infrastructure for Multi-scale Plant Phenomics and Simulation Jülich (Allemagne)
Montpellier
    EPGV Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux, US 1279 Plateforme d'acquisition Séquençage
Génotypage haut débit
Polymorphisme des génomes
Evry
  EPSI Exercise, Health, Performance, Innovation platform, Plateforme Exercice Performance Santé Innovation, EPHI Plateforme d'acquisition Activité physique adaptée
Santé
Physiologie intégrée
Physiopathologie
Sciences du mouvement humain
Besançon
  ESE Écologie, Systématique et Évolution, UMR 8079 Paris
  ESTHER database ESTerases and alpha/beta-Hydrolase Enzymes and Relatives Entrepôt de données Hydrolases
alpha/beta-Hydrolase fold
Esterases
Cholinestérases
Acétylcholinestérase
Bioinformatique
Homme
Souris
Relation structure fonction
Résidus site actif
Mutation génétique
Maladies
Résistance insecticide
Montpellier
  EU-IBISBA European Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator Toulouse
  EcogenO Plateforme d'Éco-Génomique Ecogeno Plateforme d'acquisition Plateforme de Génomique environnementale Rennes
    Ecotron Européen de Montpellier Ecotron de Montpellier, UAR 3248 Plateforme d'acquisition Montferrier-sur-Lez
  FEMTO-ST Institut Franche-Comté Electronique Mécanique Thermique et Optique – Sciences et Technologies, UMR 6174 Micro et nano-acoustique
Micro-nano-optique
Microrobotique
Sillicium
MOEMS
Besançon
  FairCarboN PEPR FairCarboN, Carbone et Écosystèmes continentaux - leviers et trajectoires pour la neutralité carbone Changement climatique
Modèles numériques
Biogéochimie
Neutralité climatique
Empreinte carbone
  FooSIN Projet FooSIN - Participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network Outils de gestion des données Principes FAIR
Ressources sémantiques
Ontologies
Thésaurus
Agriculture
Agroalimentaire
Paris
  GDEC Génétique Diversité et Écophysiologie des Céréales, UMR 1095 Blé tendre
Génomique et génétique des céréales
Clermont-Ferrand
  Geoflow INRAE Outils de gestion des données Workflow
Données FAIR
Paris
  Geosur Centre de données et de services de l'OSU-Réunion Plateforme d'accès Observation atmosphère
Pacifique Sud
Lidar
Saint-Denis de La Réunion
  GnpIS Genetic and Genomic Information System Entrepôt de données Analyse de données de séquençage NGS
Analyse de séquences
Cartographie
Génomique comparative
Versailles
  Génomique Métabolique GM Génomique Métabolique, UMR 8030
  Géoportail Portail national de la connaissance du territoire Plateforme d'accès Infrastructure nationale d'information géographique
Géomatique
Environnement
Aménagement du territoire
Biodiversité
Surfaces et Interfaces continentales
Saint Mandé
    IBISBA France Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Acceleration, IBISBA FR Ramonville Saint-Agne
  IMAG'IC Plateforme d'imagerie photonique de l'Institut Cochin Plateforme d'acquisition Imagerie moléculaire et cellulaire
Imagerie tissulaire
Imagerie intravitale
Paris
  IMBE Institut Méditerranéen de la Biodiversité et d’Écologie marine et continentale, UMR 7263 Marseille
  IMEV Institut de la Mer de Villefranche, CDS-IS-IMEV, ex Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer, FR 3761 Océan et environnement
Système Terre et environnement
Villefranche-sur-Mer
    IN-Sylva France Infrastructure Nationale de recherche pour la gestion adaptative des forêts Champenoux
  INFRAFRONTIER European Research Infrastructure for the generation, phenotyping, archiving and distribution of mouse disease models Munich (Allemagne)
    INGESTEM Infrastructure nationale des cellules souches pluripotentes et ingénierie tissulaire Villejuif
    INRAE Genomics INRAE Infrastructure de recherche distribuée en Génomique Plateforme d'acquisition Séquençage de génomes de novo
Polymorphisme génétique
Expression
Régulation de l’expression
Métagénomique.
Clermont-Ferrand
Toulouse
Castanet Tolosan
Evry
Cestas
  INRAE-DipSO Direction pour la science ouverte INRAE Science ouverte Paris
  IPHC Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR 7178 Strasbourg
  IPS2 Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay, UMR 9213 Orsay
  Ichthyop Lagrangian tool for simulating ichthyoplankton dynamics Outils de gestion des données Écologie marine
Écosystèmes marins
Dispersion d'organismes
Sète
  Institut Agro Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture Agronomie
Agriculture
Alimentation
Environnement
Vin
Horticulture
Dijon
Montpellier
Rennes
  IntelEspace Plateforme géomatique Intelespace Plateforme d'acquisition Géomatique
Cartographie
Archéologie
Géosciences
Agriculture
Clermont-Ferrand
  Isara Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes Agronomie
Agroalimentaire
Environnement
Agroécologie
Systèmes alimentaires durables
Lyon
Avignon
  Isara : Entrepôt Espace institutionnel de l'Isara Entrepôt de données Métadonnées
Espace institutionnel
Citation
Lyon
Avignon
  LAE Laboratoire Agronomie et Environnement, UMR 1121 Vandoeuvre-les-Nancy
Colmar
  LBM (UMR 5200) Laboratoire de Biogenèse Membranaire, UMR 5200 Biotechnologie
Biologie moléculaire
Lipides
Dynamique membranaire
Villenave d'Ornon
  LBTI Laboratoire de Biologie Tissulaire et d’Ingénierie thérapeutique, UMR 5305 Peau
Tissu cutané
Cicatrisation
Ciblage de molécules thérapeutiques
Réparation tissulaire
Recherche OstéoArticulaire et Dentaire
Vecteurs colloïdaux
Lyon
  LEEISA Laboratoire écologie évolution interactions des systèmes amazoniens, UAR 3456, USR 3456 Cayenne Guyane fançaise
  LPE Laboratoire Phénotypage-Endocrinologie Plateforme d'acquisition Physiologie
Reproduction des animaux
Hormone
Nouzilly
  Laboratoire de Fougères : Service IST Anses Laboratoire de Fougères Service d’information scientifique et technique Accompagnement Gestion de données de recherche
Plan de gestion de données
Sécurité alimentaire
Médecine vétérinaire
Hygiène alimentaire
Fougères
    LiPh@SAS Livestock Phenotyping for Sustainable Agricultural Systems, LiPh4SAS Alimentation
Santé
Paris
  MARBEC MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation, UMR 9190, UMR_D 248, USC 1496 Biologie marine
Écosystèmes marins
Biodiversité marine
Sète
  MEANS Plateforme MulticritEria AssessmeNt of Sustainability Plateforme d'accès Analyse multicritère
Durabilité des systèmes
Rennes
  MERMeX Marine Ecosystems Response in the Mediterranean Experiment Entrepôt de données Bassin méditerranéen
Écosystème marin
Biodiversité
Changement climatique
Modélisation
Toulouse
  MIA Mathématiques et Informatique Appliquées - Paris-Saclay, MIA - Paris-Saclay Modélisation
Apprentissage statistique
Apprentissage informatique
Palaiseau
  MICA Microscopie Imagerie Cytométrie Azur Plateforme d'acquisition Microscopie électronique
Microscopie à force atomique
Microscopie de fluorescence
Microscopie confocale
Super-résolution
PALM
STED
TIRF
FLIM
Microscopie à feuille de lumière
Cytométrie en flux
Cytométrie spectrale
Tri cellulaire
Imagerie du plancton
Taxonomie du plancton
Analyse d’images quantitative
Villefranche sur Mer
Nice
Biot
Valbonne
  MIO Institut Méditerranéen d'Océanologie, UMR 7294, UM 110, UMR D 235 Marseille
  MIRRI Microbial Ressource Research Infrastructure Braga (Portugal)
    MetaboHUB Infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l’innovation, à la formation et au transfert de technologie Villenave d'Ornon
  O3HP Oak Observatory at OHP, Observatoire du chêne pubescent Plateforme d'acquisition Biodiversité
Forêt méditerranéenne
Changements climatiques
Chênes pubescents
Saint Michel l'Observatoire
  ODK INRAE OpenDataKit INRAE Outils de gestion des données Sciences participatives Paris
  OENO Unité de recherche œnologie, EA 4577, UMR 1366 Vin
Microorganismes
Villenave d’Ornon
  ORDaR OTELo Research Data Repository Entrepôt de données Vandoeuvre-les-Nancy
  OSERen Observatoire des Sciences de l'Environnement de Rennes, OSU OSERen, OSUR (ancien nom) Système Terre et environnement Rennes
  OTELo Observatoire Terre et Environnement Lorraine, OSU OTELo Vandoeuvre-les-Nancy
  OpenImadis iManage Strandls, curie Image Data Management Outils de gestion des données Imagerie médicale
Gestion de données
Visualisation
Annotation
Paris
Nantes
  PAM Plateforme d'Analyse du Mouvement Plateforme d'acquisition Biomécanique
Cinématique
Cinétique
Electrophysiologie
Oculométrie
Motion Capture
Analyse du Mouvement Humain
Motricité
Bordeaux
  PGT Pre industrial Gene Therapy consortium, Consortium Préindustriel des vecteurs de Thérapie Génique
    PGTB Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux Plateforme d'acquisition Génomique
Séquençage
Génotypage
Biodiversité
Metabarcoding
Longs-reads
Bioanalyse
Cestas
  PHENOMIN French National Infrastructure for Mouse Phenogenomics Phénogénomique
  PHENOMIN-CIPHE Centre d’Immunophénomique,CIPHE, UMS 3367, US 12 Plateforme d'acquisition Marseille
  PHENOMIN-ICS Institut Clinique de la Souris, ICS Plateforme d'acquisition Illkirch-Graffenstaden
  PHENOMIN-TAAM Typage et Archivage d'Animaux Modèles, TAAM, UAR 44 Plateforme d'acquisition Orléans
  PIC Plateau d'Imagerie Cellulaire Plateforme d'acquisition Microscopie photonique
Biologie de la reproduction
Neurobiologie
Nouzilly
  PIV Plateforme Imageries du Vivant de l’Institut Cochin Plateforme d'acquisition Explorations physiologiques & fonctionnelles
Imagerie in vivo
Recherche pré-clinique
Paris
  PIXANIM Phénotypage par Imagerie in et ex vivo de l'Animal à la Molécule Plateforme d'acquisition Phénotypage
Métabolomique
Exploration fonctionnelle
IRM
Nouzilly
  PLBS Plateformes Lilloises en Biologie Santé, UAR 2014, US41 Biologie et santé Lille
  PO² Process & Observation Ontology Outils de gestion des données Ontologie
Structure des aliments
Nutrition
Sciences alimentaires
Palaiseau
  PPanGGOLiN Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors Outils de gestion des données Logiciel
Pangénomique
Génomique comparative
Evry
  PRC Physiologie de la reproduction et des comportements, UMR 7247, UMR 0085 Neuroendocrinologie
Biologie du comportement
Biologie de la reproduction
Biologie systémique et de la modélisation
Nouzilly
    Phenome-Emphasis France Infrastructure Francaise de Phenomique Végétale, European Infrastructure for multi-scale Plant Phenomics and Simulation for food security in a changing climate France Montpellier
  PlantBioInfoPF Plant Bioinformatics Facility, Plateforme de bioinformatique des plantes Plateforme de calcul Plateforme de bioinformatique Versailles
  Puéchabon Site expérimental de Puéchabon Plateforme d'acquisition Écosystème forestier méditerranéen
Changements climatiques
Biodiversité
Puéchabon
    RARe Ressources Agronomiques pour la Recherche Jouy-en-Josas
  RECOVER Risques ECOsystèmes Vulnérabilité Environnement Résilience, UMR 1467 Le Tholonet
  SAS Sol Agro et hydrosystème Spatialisation, UMR 1069 Rennes
Quimper
  SFR Biosciences UAR 3444,US 8, 851
  SFR Santé Lyon Est Fédération de Recherche Louis Léopold Ollier, UAR 3453, US 7 Lyon
  SILABE Simian Laboratory Europe Plateforme d'acquisition Primates non-humains Niederhausbergen
  SPlotOpen Plateforme d'accès Biodiversité
Communautés végétales terrestres
Changements globaux
Changements climatiques
Écologie
Leipzig (Allemagne)
  SVA PEPR SVA, Sélection Végétale Avancée Édition des génomes
Génomique
  SYGADE Plateforme d'accès Entretien Paris
  Science ouverte INRAE Gestion et partage des données scientifiques Information Identifiants pérennes
Plan de gestion de données
Supports de formation
Tutoriels
Ontologies
Zenodo INRAE
Principes FAIR
Science ouverte
Bonnes pratiques
Agronomie
Agriculture
Alimentation
Environnement
Paris
  TEFOR Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Illkirch
  TEFOR Fly Facility Plateforme d'acquisition Drosophile
Ingénierie génétique
Phénotypage
Clermont-Ferrand
  TEFOR Paris Saclay Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS Plateforme d'acquisition Poisson zèbre
Autres poissons modèles
Modèles aquatiques
Zootechnie
Production de lignées d'intérêt
Imagerie
Reconstitution 3D
Gestion de données
Édition du génome
Saclay
  TEFOR-TACGENE Plateforme d'acquisition Paris
  TETIS UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470 Territoires
Environnement
Télédétection et Information Spatiale
Montpellier
  TETIS : Plateformes de données Plateformes de données de UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470 Entrepôt de données Territoires
Environnement
Télédétection et Information Spatiale
Montpellier
  TRIP Transgenic Rats Immunophenomic Platform, Transgenèse Rat et Immunophénomique Plateforme d'acquisition Nantes
  Tela Botanica Réseau des botanistes francophones, Réseau Tela Botanica Plateforme d'accès Botanique
Sciences participatives
Montpellier
  Théia Animation régionale Theia réseau Animation régionale ART, Animation régionale Theia (ART) Accompagnement Télédétection
Observation spatiale
Surfaces et Interfaces continentales
  URGI Unité de Recherche Génomique-Info, UR 1164
  WheatIS Wheat@URGI, Plateforme d'accès Analyse de données de séquençage NGS
Analyse de séquences
Versailles
  e-RECOLNAT Portail du réseau des collections naturalistes françaises e-ReColNat Plateforme d'accès Botanique
Zoologie
Paléontologie
Biodiversité
Géodiversité
Collections naturalistes
Herbier
Interopérabilité
Darwin Core
Paris

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