LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
Biotechnologie utilisant tous les organismes, biotechnologie pour les applications environnementales et alimentaires, sciences appliquées aux plantes et aux animaux, bioingénierie et biologie synthétique, biomasse et biocarburants, risques biologiques
A ce jour 120 entités sont référencées dans le sous-domaine LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
- AFMB
- AGAP
- Adonis
- AnaEE-France Metadata Catalog
- Anexplo
- AniRA
- Anses
- Anses Laboratoire de Fougères Service IST
- B-BEST
- BALISTE
- BIII
- BIOBANQUES
- BIP
- BioEmergences
- Biothérapies
- CAD
- CALIS
- CCMA
- CESCO
- CID
- CNRGV
- CNRS Biologie
- Celphedia
- ChemBioFrance
- Chronobiotron
- Cid.curie.fr
- Cirad Dataverse
- Data INRAE
- DataSuds
- Dinamis
- DyNAFOR
- ECCOREV
- ECELLFrance
- EMBRC ERIC
- EMBRC France
- EMERG'IN
- EMPHASIS
- EPGV
- ESE
- ESTHER database
- EU-IBISBA
- EcogenO
- Ecotron Européen de Montpellier
- FEMTO-ST
- FairCarboN
- FooSIN
- GDEC
- Geoflow INRAE
- Geosur
- GnpIS
- Génomique Métabolique
- Géoportail
- IBISBA France
- IMAG'IC
- IMBE
- IMEV
- IN-Sylva France
- INFRAFRONTIER
- INGESTEM
- INRAE Genomics
- INRAE-DipSO
- IPHC
- IPS2
- IntelEspace
- LAE
- LBM (UMR 5200)
- LBTI
- LEEISA
- LPE
- LiPh@SAS
- MERMeX
- MICA
- MIO
- MIRRI
- MetaboHUB
- O3HP
- ODK INRAE
- OENO
- ORDaR
- OSUR
- OTELo
- OpenImadis
- PAM
- PGT
- PGTB
- PHENOMIN
- PHENOMIN-CIPHE
- PHENOMIN-ICS
- PHENOMIN-TAAM
- PIC
- PIV
- PIXANIM
- PPanGGOLiN
- PRC
- Phenome-Emphasis France
- PlantBioInfoPF
- Plateformes Lilloises en Biologie et Santé
- Puéchabon
- RARe
- RECOVER
- SAS
- SFR Biosciences
- SFR Santé Lyon Est
- SILABE
- SPlotOpen
- SVA
- SYGADE
- Science ouverte INRAE
- TEFOR
- TEFOR Fly Facility
- TEFOR Paris Saclay
- TEFOR-TACGENE
- TETIS
- TETIS : Plateformes de données
- TRIP
- Tela Botanica
- Théia Animation régionale
- URGI
- WheatIS
- e-RECOLNAT
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Légende : 
Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche 
Service 
Structure
Tableau
| Acronyme | Nom développé | Type de service | Thématique/Mots clés | Localisation | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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AFMB | Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, UMR 7257 | Complexes Macromoléculaires Viraux Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire Glycobiologie et Neurobiologie Structurales Glycogénomique Interactions hôte-pathogène Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design |
Marseille | |||
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AGAP | Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales, UMR 108, UMR 1334 | Agrobiodiversité | Montpellier Guadeloupe Martinique |
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Adonis | Acquisition de DONnéeS à l’Inra | Outils de gestion des données | Saisie données d'observation Expérimentation de terrain Logiciel |
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AnaEE-France Metadata Catalog | Plateforme d'accès | Écosystèmes continentaux | ||||
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Anexplo | Plateforme d'acquisition | Phénotypage animal | Toulouse | |||
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AniRA | plateforme régionale Ani-Rhone-Alpes | Plateforme d'acquisition | Lyon | |||
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Anses | Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail | |||||
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Anses Laboratoire de Fougères Service IST | Anses Laboratoire de Fougères Service d’information scientifique et technique | Accompagnement | Gestion de données de recherche Plan de gestion de données Sécurité alimentaire Médecine vétérinaire Hygiène alimentaire |
Fougères | ||
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B-BEST | PEPR B-BEST, Biomasses, biotechnologies et technologies durables pour la chimie et les carburants | Produits biosourcés Chimie durable Biocarburants Biotechnologies Énergie |
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BALISTE | Base de données naturalistes partagée | Outils de gestion des données | Protocoles Méthodes d'observation |
Paris | ||
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BIII | BioImage Informatics Index, BISE | Plateforme d'accès | Bioimagerie Analyse d'images |
Nantes | ||
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BIOBANQUES | Infrastructure nationale BIOBANQUES,US 13 | |||||
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BIP | Bioénergétique et ingénierie des protéines, UMR 7281 | Bioénergétique Ingénierie des protéines |
Marseille | |||
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BioEmergences | Dynamiques multiéchelles dans la morphogenèse, Multilevel Dynamics in Morphogenesis, FRE 2039 | Plateforme d'accès | Morphogenèse Imagerie biomédicale |
Gif-sur-Yvette | |
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Biothérapies | PEPR BBTI, PEPR Biothérapies, Biothérapies et Bioproduction de Thérapies Innovantes | Bioproduction Thérapies géniques Thérapies cellulaires Thérapies tissulaires |
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CAD | Collecteur Analyseur de Données | Bruyères-le-Châtel | |||
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CALIS | Infrastructure Nationale de Recherche Consommateur-ALIment-Santé | Agronomie Alimentation Santé |
Rennes | ||
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CCMA | Centre Commun de Microscopie Appliquée | Plateforme d'acquisition | Nice | ||
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CESCO | Centre d'Écologie et des Sciences de la Conservation, UMR 7204 | Paris Brunoy Concarneau |
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CID | Cochin Image Database | Outils de gestion des données | Imagerie Cytométrie Protéomique |
Paris | ||
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CNRGV | Centre National de Ressources Génomiques Végétales, UR 1258 | Plateforme d'acquisition | Génomique végétale | Castanet Tolosan | |
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CNRS Biologie | Institut des sciences biologiques du CNRS, CNRS-INSB | Paris | ||||
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Celphedia | Création Elevage PHénotypage Distribution et Archivage d’organismes modèles | Illkirch-Graffenstaden | |||
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ChemBioFrance | Plateforme de découverte de molécules bioactives pour comprendre et soigner le vivant; Infrastructure de recherche « des petites molécules pour comprendre et soigner le vivant » | Montpellier Illkirch-Graffenstaden |
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Chronobiotron | UAR 3415 | Plateforme d'acquisition | Strasbourg | |||
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Cid.curie.fr | Curie Image Database,iManage, OpenImadis | Entrepôt de données | Imagerie médicale Algorithme d'analyse Microscopie électronique |
Paris | ||
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Cirad Dataverse | Entrepôt de données de recherche du Cirad | Entrepôt de données | Agriculture Alimentation Environnement Gestion des territoires |
Montpellier | ||
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Data INRAE | Portail Data INRAE, Portail des données Inrae, Espace institutionnel de données INRAE | Entrepôt de données | Écologie Science appliquée des végétaux et des animaux Science des aliments Métadonnées DataCite Dataverse Espace institutionnel Citation |
Versailles | ||
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DataSuds | Des données ouvertes pour une science durable au Sud, Dataverse IRD | Entrepôt de données | Sciences environnementales Sciences sociales Sciences biologiques Santé DOI Dataverse |
Marseille | ||
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Dinamis | Dispositif Institutionnel National d’Approvisionnement Mutualisé en Imagerie Satellitaire | Plateforme d'accès | Imagerie satellitaire | Montpellier | ||
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DyNAFOR | Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, UMR 1201 | Écologie des paysages Géographie sociale Télédétection Biologie de la conservation Agronomie |
Auzeville | |||
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ECCOREV | Ecosystèmes continentaux et risques environnementaux, FR 3098 | |||||
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ECELLFrance | Plateforme nationale pour la médecine régénératrice basée sur les cellules souches mesenchymateuses adultes,ECELL FRANCE | Montpellier | |||
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EMBRC ERIC | European Marine Biological Resource Centre | Paris | ||||
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EMBRC France | Centre National de ressources biologiques marines, UAR 2209 | Paris Banyuls-sur-Mer Roscoff Villefranche-sur-Mer |
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EMERG'IN | Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l’exploration in vivo | Nouzilly | |||
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EMPHASIS | European Infrastructure for Multi-scale Plant Phenomics and Simulation | Jülich (Allemagne) Montpellier |
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EPGV | Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux, US 1279 | Plateforme d'acquisition | Séquençage Génotypage haut débit Polymorphisme des génomes |
Evry | |
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ESE | Écologie, Systématique et Évolution, UMR 8079 | Paris | ||||
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ESTHER database | ESTerases and alpha/beta-Hydrolase Enzymes and Relatives | Entrepôt de données | Hydrolases alpha/beta-Hydrolase fold Esterases Cholinestérases Acétylcholinestérase Bioinformatique Homme Souris Relation structure fonction Résidus site actif Mutation génétique Maladies Résistance insecticide |
Montpellier | ||
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EU-IBISBA | European Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator | Toulouse | ||||
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EcogenO | Plateforme d'Éco-Génomique Ecogeno | Plateforme d'acquisition | Plateforme de Génomique environnementale | Rennes | ||
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Ecotron Européen de Montpellier | Ecotron de Montpellier, UAR 3248 | Plateforme d'acquisition | Montferrier-sur-Lez | ||
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FEMTO-ST | Institut Franche-Comté Electronique Mécanique Thermique et Optique – Sciences et Technologies, UMR 6174 | Micro et nano-acoustique Micro-nano-optique Microrobotique Sillicium MOEMS |
Besançon | |||
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FairCarboN | PEPR FairCarboN, Carbone et Écosystèmes continentaux - leviers et trajectoires pour la neutralité carbone | Changement climatique Modèles numériques Biogéochimie Neutralité climatique Empreinte carbone |
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FooSIN | Projet FooSIN - Participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network | Outils de gestion des données | Principes FAIR Ressources sémantiques Ontologies Thésaurus Agriculture Agroalimentaire |
Paris | ||
| |
GDEC | Génétique Diversité et Écophysiologie des Céréales, UMR 1095 | Blé tendre Génomique et génétique des céréales |
Clermont-Ferrand | |||
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Geoflow INRAE | Outils de gestion des données | Workflow Données FAIR |
Paris | |||
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Geosur | Centre de données et de services de l'OSU-Réunion | Plateforme d'accès | Observation atmosphère Pacifique Sud Lidar |
Saint-Denis de La Réunion | ||
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GnpIS | Genetic and Genomic Information System | Entrepôt de données | Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences Cartographie Génomique comparative |
Versailles | ||
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Génomique Métabolique | GM Génomique Métabolique, UMR 8030 | |||||
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Géoportail | Portail national de la connaissance du territoire | Plateforme d'accès | Infrastructure nationale d'information géographique Géomatique Environnement Aménagement du territoire Biodiversité Surfaces et Interfaces continentales |
Saint Mandé | ||
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IBISBA France | Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Acceleration, IBISBA FR | Ramonville Saint-Agne | |||
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IMAG'IC | Plateforme d'imagerie photonique de l'Institut Cochin | Plateforme d'acquisition | Imagerie moléculaire et cellulaire Imagerie tissulaire Imagerie intravitale |
Paris | ||
| |
IMBE | Institut Méditerranéen de la Biodiversité et d’Écologie marine et continentale, UMR 7263 | Marseille | ||||
| |
IMEV | Institut de la Mer de Villefranche, CDS-IS-IMEV, ex Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer, FR 3761 | Océan et environnement Système Terre et environnement |
Villefranche-sur-Mer | |||
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IN-Sylva France | Infrastructure Nationale de recherche pour la gestion adaptative des forêts | Champenoux | |||
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INFRAFRONTIER | European Research Infrastructure for the generation, phenotyping, archiving and distribution of mouse disease models | Munich (Allemagne) | ||||
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INGESTEM | Infrastructure nationale des cellules souches pluripotentes et ingénierie tissulaire | Villejuif | |||
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INRAE Genomics | INRAE Infrastructure de recherche distribuée en Génomique | Plateforme d'acquisition | Séquençage de génomes de novo Polymorphisme génétique Expression Régulation de l’expression Métagénomique. |
Clermont-Ferrand Toulouse Castanet Tolosan Evry Cestas |
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| |
INRAE-DipSO | Direction pour la science ouverte INRAE | Science ouverte | Paris | |||
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IPHC | Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR 7178 | Strasbourg | ||||
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IPS2 | Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay, UMR 9213 | Orsay | ||||
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IntelEspace | Plateforme géomatique Intelespace | Plateforme d'acquisition | Géomatique Cartographie Archéologie Géosciences Agriculture |
Clermont-Ferrand | ||
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LAE | Laboratoire Agronomie et Environnement, UMR 1121 | Vandoeuvre-les-Nancy Colmar |
||||
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LBM (UMR 5200) | Laboratoire de Biogenèse Membranaire, UMR 5200 | Biotechnologie Biologie moléculaire Lipides Dynamique membranaire |
Villenave d'Ornon | |||
| |
LBTI | Laboratoire de Biologie Tissulaire et d’Ingénierie thérapeutique, UMR 5305 | Peau Tissu cutané Cicatrisation Ciblage de molécules thérapeutiques Réparation tissulaire Recherche OstéoArticulaire et Dentaire Vecteurs colloïdaux |
Lyon | |||
| |
LEEISA | Laboratoire écologie évolution interactions des systèmes amazoniens, UAR 3456, USR 3456 | Cayenne Guyane fançaise | ||||
| |
LPE | Laboratoire Phénotypage-Endocrinologie | Plateforme d'acquisition | Physiologie Reproduction des animaux Hormone |
Nouzilly | ||
| |
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LiPh@SAS | Livestock Phenotyping for Sustainable Agricultural Systems, LiPh4SAS | Alimentation Santé |
Paris | ||
| |
MERMeX | Marine Ecosystems Response in the Mediterranean Experiment | Entrepôt de données | Bassin méditerranéen Écosystème marin Biodiversité Changement climatique Modélisation |
Toulouse | ||
| |
MICA | Microscopie Imagerie Cytométrie Azur | Plateforme d'acquisition | Microscopie électronique Microscopie à force atomique Microscopie de fluorescence Microscopie confocale Super-résolution PALM STED TIRF FLIM Microscopie à feuille de lumière Cytométrie en flux Cytométrie spectrale Tri cellulaire Imagerie du plancton Taxonomie du plancton Analyse d’images quantitative |
Villefranche sur Mer Nice Biot Valbonne |
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MIO | Institut Méditerranéen d'Océanologie, UMR 7294, UM 110, UMR D 235 | Marseille | ||||
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MIRRI | Microbial Ressource Research Infrastructure | Braga (Portugal) | ||||
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MetaboHUB | Infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l’innovation, à la formation et au transfert de technologie | Villenave d'Ornon | |||
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O3HP | Oak Observatory at OHP, Observatoire du chêne pubescent | Plateforme d'acquisition | Biodiversité Forêt méditerranéenne Changements climatiques Chênes pubescents |
Saint Michel l'Observatoire | ||
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ODK INRAE | OpenDataKit INRAE | Outils de gestion des données | Sciences participatives | Paris | ||
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OENO | Unité de recherche œnologie, EA 4577, UMR 1366 | Vin Microorganismes |
Villenave d’Ornon | |||
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ORDaR | OTELo Research Data Repository | Entrepôt de données | Vandoeuvre-les-Nancy | |||
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OSUR | Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes, OSU OSUR | Système Terre et environnement | Rennes | |||
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OTELo | Observatoire Terre et Environnement Lorraine, OSU OTELo | Vandoeuvre-les-Nancy | ||||
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OpenImadis | iManage Strandls, curie Image Data Management | Outils de gestion des données | Imagerie médicale Gestion de données Visualisation Annotation |
Paris Nantes |
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PAM | Plateforme d'Analyse du Mouvement | Plateforme d'acquisition | Biomécanique Cinématique Cinétique Electrophysiologie Oculométrie Motion Capture Analyse du Mouvement Humain Motricité |
Bordeaux | ||
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PGT | Pre industrial Gene Therapy consortium, Consortium Préindustriel des vecteurs de Thérapie Génique | |||||
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PGTB | Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux | Plateforme d'acquisition | Génomique Séquençage Génotypage Biodiversité Metabarcoding Longs-reads Bioanalyse |
Cestas | |
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PHENOMIN | French National Infrastructure for Mouse Phenogenomics | Phénogénomique | ||||
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PHENOMIN-CIPHE | Centre d’Immunophénomique,CIPHE, UMS 3367, US 12 | Plateforme d'acquisition | Marseille | |||
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PHENOMIN-ICS | Institut Clinique de la Souris, ICS | Plateforme d'acquisition | Illkirch-Graffenstaden | |||
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PHENOMIN-TAAM | Typage et Archivage d'Animaux Modèles, TAAM, UAR 44 | Plateforme d'acquisition | Orléans | |||
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PIC | Plateau d'Imagerie Cellulaire | Plateforme d'acquisition | Microscopie photonique Biologie de la reproduction Neurobiologie |
Nouzilly | ||
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PIV | Plateforme Imageries du Vivant de l’Institut Cochin | Plateforme d'acquisition | Explorations physiologiques & fonctionnelles Imagerie in vivo Recherche pré-clinique |
Paris | ||
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PIXANIM | Phénotypage par Imagerie in et ex vivo de l'Animal à la Molécule | Plateforme d'acquisition | Phénotypage Métabolomique Exploration fonctionnelle IRM |
Nouzilly | ||
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PPanGGOLiN | Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors | Outils de gestion des données | Logiciel Pangénomique Génomique comparative |
Evry | ||
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PRC | Physiologie de la reproduction et des comportements, UMR 7247, UMR 0085 | Neuroendocrinologie Biologie du comportement Biologie de la reproduction Biologie systémique et de la modélisation |
Nouzilly | |||
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Phenome-Emphasis France | Infrastructure Francaise de Phenomique Végétale, European Infrastructure for multi-scale Plant Phenomics and Simulation for food security in a changing climate France | Montpellier | |||
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PlantBioInfoPF | Plant Bioinformatics Facility, Plateforme de bioinformatique des plantes | Plateforme de calcul | Plateforme de bioinformatique | Versailles | ||
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Plateformes Lilloises en Biologie et Santé | PLBS, UMS 2014, US41 | |||||
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Puéchabon | Site expérimental de Puéchabon | Plateforme d'acquisition | Écosystème forestier méditerranéen Changements climatiques Biodiversité |
Puéchabon | ||
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RARe | Ressources Agronomiques pour la Recherche | Jouy-en-Josas | |||
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RECOVER | Risques ECOsystèmes Vulnérabilité Environnement Résilience, UMR 1467 | Le Tholonet | ||||
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SAS | Sol Agro et hydrosystème Spatialisation, UMR SAS | Rennes Quimper |
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SFR Biosciences | UAR 3444,US 8, 851 | |||||
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SFR Santé Lyon Est | Fédération de Recherche Louis Léopold Ollier, UAR 3453, US 7 | Lyon | ||||
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SILABE | Simian Laboratory Europe | Plateforme d'acquisition | Primates non-humains | Niederhausbergen | ||
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SPlotOpen | Plateforme d'accès | Biodiversité Communautés végétales terrestres Changements globaux Changements climatiques Écologie |
Leipzig (Allemagne) | |||
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SVA | PEPR SVA, Sélection Végétale Avancée | Édition des génomes Génomique |
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SYGADE | Plateforme d'accès | Entretien | Paris | |||
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Science ouverte INRAE | Gestion et partage des données scientifiques | Information | Identifiants pérennes Plan de gestion de données Supports de formation Tutoriels Ontologies Zenodo INRAE Principes FAIR Science ouverte Bonnes pratiques Agronomie Agriculture Alimentation Environnement |
Paris | ||
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TEFOR | Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles | Illkirch | ||||
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TEFOR Fly Facility | Plateforme d'acquisition | Drosophile Ingénierie génétique Phénotypage |
Clermont-Ferrand | |||
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TEFOR Paris Saclay | Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS | Plateforme d'acquisition | Poisson zèbre Autres poissons modèles Modèles aquatiques Zootechnie Production de lignées d'intérêt Imagerie Reconstitution 3D Gestion de données Édition du génome |
Saclay | ||
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TEFOR-TACGENE | Plateforme d'acquisition | Paris | ||||
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TETIS | UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470 | Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale |
Montpellier | |||
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TETIS : Plateformes de données | Plateformes de données de UMR TETIS, Territoires, Environnement, Télédetection et Information Spatiale, UMR 91, UMR 9000, UMR 1470 | Entrepôt de données | Territoires Environnement Télédétection et Information Spatiale |
Montpellier | ||
| |
TRIP | Transgenic Rats Immunophenomic Platform, Transgenèse Rat et Immunophénomique | Plateforme d'acquisition | Nantes | |||
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Tela Botanica | Réseau des botanistes francophones, Réseau Tela Botanica | Plateforme d'accès | Botanique Sciences participatives |
Montpellier | ||
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Théia Animation régionale | Theia réseau Animation régionale ART, Animation régionale Theia (ART) | Accompagnement | Télédétection Observation spatiale Surfaces et Interfaces continentales |
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URGI | Unité de Recherche Génomique-Info, UR 1164 | |||||
| |
WheatIS | Wheat@URGI, | Plateforme d'accès | Analyse de données de séquençage NGS Analyse de séquences |
Versailles | ||
| |
e-RECOLNAT | Portail du réseau des collections naturalistes françaises e-ReColNat | Plateforme d'accès | Botanique Zoologie Paléontologie Biodiversité Géodiversité Collections naturalistes Herbier Interopérabilité Darwin Core |
Paris |
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