IFB
| Autres noms | Institut Français de Bioinformatique, ELIXIR France |
|---|---|
| URL | http://www.france-bioinformatique.fr/ |
| Tutelles | CNRS-INSB, CNRS-INS2I, CEA, INRAE, INRIA, INSERM |
| Identifiant dans un autre catalogue | https://appliweb.dgri.education.fr/rnsr/PresenteStruct.jsp?numNatStruct=201321719F&PUBLIC=OK (RNSR) |
L’Institut Français de Bioinformatique, IFB, est une infrastructure nationale de service en bioinformatique (calcul, stockage, outils, bases de données, accompagnements de projets, formations). Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. L'IFB fédère les services et les ressources de 31 plateformes en bioinformatique dont l'IFB-core. Ces services consistent à :
- Fournir un accès à des bases de données spécialisées à haute valeur ajoutée issues de l’expertise scientifique du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition des outils et des services en ligne correspondant aux domaines d’expertise du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à la gestion et l’analyse des données des sciences du vivant
- Fournir un appui aux projets scientifiques de la communauté des sciences du vivant et assurer leur hébergement sur une infrastructure informatique adaptée
- Offrir des formations en bioinformatique
L’accès aux données produites par l’infrastructure IFB est restreint : les données restent accessibles uniquement aux propriétaires et aux collaborateurs avant publication des résultats.
L'IFB est le noeud français, ELIXIR-FR de l’infrastructure de recherche européenne d’ELIXIR.
L'IFB a développé, en coopération avec MetaboHUB, Workflow4Metabolomics, W4M, portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.
Offre de services de IFB
- FAIR-Checker (Outils de gestion des données)
- W4M (Outils de gestion des données)
- Orphanet (Plateforme d'accès)
- ABiMS (Plateforme de calcul)
- ARTbio (Plateforme de calcul)
- ATGC (Plateforme de calcul)
- AuBI (Plateforme de calcul)
- BiGEst (Plateforme de calcul)
- BiGR (Plateforme de calcul)
- Bilille (Plateforme de calcul)
- CBiB (Plateforme de calcul)
- DAC (Plateforme de calcul)
- GenOuest (Plateforme de calcul)
- GenoToul Bioinfo (Plateforme de calcul)
- MBI-DS4H (Plateforme de calcul)
- MicroScope (Plateforme de calcul)
- Migale (Plateforme de calcul)
- P3M (Plateforme de calcul)
- PACA BioInfo (Plateforme de calcul)
- PRABI Lyon-Gerland (Plateforme de calcul)
- Pasteur HUB (Plateforme de calcul)
- PlantBioInfoPF (Plateforme de calcul)
- RPBS (Plateforme de calcul)
- South Green (Plateforme de calcul)
- iCONICS (Plateforme de calcul)
IFB est en lien avec les services et structures
France Grilles, IDRIS, France Génomique, CCRT, MetaboHUB, CAD, CINES, CC-IN2P3, IPHC, Inist-CNRS, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques, MGP, CRefIX
Portée internationale de IFB
ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/), ESFRI Landmark (https://www.esfri.eu/)