ABiMS

ABiMS

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science.
URL	http://abims.sb-roscoff.fr
Contact	support.abims@sb-roscoff.fr
Localisation	Roscoff
Structure d'appartenance	IFB, SBR
Tutelles	CNRS, Sorbonne Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

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La plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science, met à disposition une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows(outils, portail,...) .

ABiMS est partie intégrante de la Station Biologique de Roscoffet est rattachée au Service Informatique et Bioinformatique. Elle est intégrée à l’Institut Français de Bio-informatique (IFB) et à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et l’analyse des données issues du monde marin (algues, poissons, cyanobactéries, picoplancton...), et sont en lien direct avec les 2 axes de recherche de la Station Biologique que sont la biologie et l'écologie. ABiMS interagit avec les équipes de recherche dans le cadre de collaborations scientifiques formalisées, ou sous la forme de prestations.

Mise à disposition d’une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows (outils, portail...).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (http://abims.sb-roscoff.fr/sites/abims.sb-roscoff.fr/files/paq.pdf)

IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

ABiMS est en lien avec les services et structures

EMBRC France, France Génomique

Portée internationale de ABiMS

EMBRC ERIC (http://www.embrc.eu/)

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale VirHostNet ARTbio DAC FAIR-Checker
SBR	ABiMS SulfAtlas

Centre National de la Recherche Scientifique