DAC
| |
|---|---|
| Type de service | Plateforme d'accès |
| Statut | En production |
| Autres noms | The Data Analysis Core |
| URL | https://dac.institutducerveau-icm.org/ |
| Contact | dac@icm-institute.org |
| Localisation | Paris |
| Structure d'appartenance | ICM |
| Tutelles | CNRS, AP-HP, INSERM, Sorbonne Université |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Page en construction
Les activités du Data Analysis Core exploitent les équipements de calcul haute performance gérés par le département IT, dont une plateforme Bio-IT Illumina DRAGEN, des serveurs de base de données, un stockage haute performance, un cluster de 800 cœurs et des serveurs d'application. En collaboration avec les chercheurs, les plateformes et les services de soutien à la recherche de l'institut, le Data Analysis Core facility optimise l'institut pour le cloud computing à haut débit, le stockage, le traitement et le partage des données, afin de permettre à ses chercheurs de répondre à leurs questions.
Elle est organisé en quatre divisions :
- La division bioinformatique développe, exécute des pipelines et fournit des interfaces pour traiter et visualiser les données de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris la génomique (panel de gènes, séquençage de l'exome entier et du génome entier), la transcriptomique (analyses de l'ARN-seq en vrac et de l'ARN-seq dans une seule cellule), l'épigénomique (accessibilité de la chromatine ATAC-seq) et la ChIP-seq (liaison des protéines).
- La division biostatistique fournit un soutien expert en matière d'analyse statistique pour tout type de données biologiques. Elle fonctionne comme un service d'assistance réactif qui fournit un soutien en matière d'analyse statistique aux chercheurs tout au long de leurs projets de recherche. Elle anticipe et répond aux besoins émergents de l'institut en concevant des méthodes statistiques avancées pour traiter l'analyse intégrée de données multidimensionnelles et multimodales, y compris les données omiques, électrophysiologiques, d'imagerie cellulaire, de neuro-imagerie et cliniques.t des analyses pour les analyses morphologiques et les statistiques descriptives.
- La division de gestion des données offre un soutien opérationnel aux chercheurs dans la gestion des exigences croissantes en matière de trouvabilité, d'accès, d'interopérabilité et de réutilisation de leurs données (FAIR) en fournissant des bases de données et des interfaces web sécurisées selon des modèles de données partagés. La division met en œuvre la vision de l'institut qui consiste à maximiser l'impact de sa recherche en exploitant le potentiel transversal de son entrepôt de données. La division joue également un rôle central dans la mise en œuvre de la politique de gestion des données de l'institut, en développant des plans de gestion des données en collaboration avec les responsables juridiques, de la protection des données et de l'intégrité, ainsi qu'avec le bureau de l'innovation.
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
PE6 Sciences informatiques et informatique
LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique dans le domaine des neurosciences Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, cliniciens
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
DAC est en lien avec les services et structures