DAC
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| Type de service | Plateforme d'accès |
| Statut | En production |
| Autres noms | The Data Analysis Core |
| URL | https://dac.institutducerveau-icm.org/ |
| Contact | dac@icm-institute.org |
| Localisation | Paris |
| Structure d'appartenance | ICM |
| Tutelles | CNRS, AP-HP, INSERM, Sorbonne Université |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Page en construction
The Data Analysis Core (DAC) fournit à l'Institut du Cerveau de Paris un soutien structurel et une expertise dans le traitement, l'intégration et l'analyse de données de la recherche fondamentale et clinique en neurosciences.
Elle est organisé en quatre divisions :
- La division d'Analyse omique spécialisée dans l’analyse des données de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris la génomique (panel de gènes, séquençage de l’exome entier et du génome entier), la transcriptomique (ARN-seq en vrac, ARN non codant, petit ARN, variants d’épissage), l’ARN-seq unicellulaire, la transcriptomique spatiale, l’épigénétique (méthylation, ATAC-seq, ChIP-seq) et les technologies long-reads (ONT). Des pipelines automatisés sont développés pour la reproductibilité et l’extensibilité et mis en œuvre sur des serveurs spécialisés à haute performance. Des interfaces utilisateur graphiques sont développées pour explorer les données transcriptomiques provenant d’expériences d’ARN-seq en vrac et unicellulaires (QuBy), et les variants identifiés dans le cadre de ses études de recherche (DejaVu).
- La division d'Analyse d’images aide les chercheurs à analyser les images provenant de toutes les technologies d’imagerie en étroite collaboration avec les plateformes QUANT, CENIR et Histomics, y compris la photonique/électromicroscopie et la neuro-imagerie. La division fournit une assistance dans le cadre de projets de segmentation et de classification basées sur l’IA et développe des outils et des analyses pour les analyses morphologiques et les statistiques descriptives.
- La divisionStatistiques et méthodologie offre un soutien expert en matière d’analyse statistique et fournit un soutien méthodologique pour toute partie d’un projet de recherche, des analyses de puissance à la modélisation statistique, en passant par la visualisation et l’interprétation. La division répond aux besoins actuels et anticipe les développements futurs en développant de nouvelles méthodes statistiques pour traiter l’analyse intégrative des données multidimensionnelles et multimodales collectées et étudiées à l’institut.
- La division Gouvernance des données et science ouverte met en œuvre la vision de l’institut qui consiste à maximiser l’impact de sa recherche en fournissant des outils et des conseils aux chercheurs pour exploiter le potentiel de leur collection de données. La division contribue à la mise en œuvre de la politique de gestion des données de l’institut en collaboration avec le comité technique et réglementaire (CART) et aide à la création et à la maintenance des plans de gestion des données des chercheurs. La division développe et fournit un support technique pour les bases de données relationnelles avec des interfaces web sécurisées, soutenues par un modèle de données partagé, qui couvre l’éventail des données collectées et recherchées à l’institut.
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
PE6 Sciences informatiques et informatique
LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
DAC est en lien avec les services et structures