ABiMS
Type de service | Plateforme de calcul |
---|---|
Statut | En production |
Autres noms | Plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science |
URL | http://abims.sb-roscoff.fr |
Contact | support.abims@sb-roscoff.fr |
Localisation | Roscoff |
Structure d'appartenance | IFB, SBR |
Tutelles | CNRS, Sorbonne Université |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
ABiMS est partie intégrante de la Station Biologique de Roscoffet est rattachée au Service Informatique et Bioinformatique. Elle est intégrée à l’Institut Français de Bio-informatique (IFB) et à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent l’étude et l’analyse des données issues du monde marin (algues, poissons, cyanobactéries, picoplancton...), et sont en lien direct avec les 2 axes de recherche de la Station Biologique que sont la biologie et l'écologie. ABiMS interagit avec les équipes de recherche dans le cadre de collaborations scientifiques formalisées, ou sous la forme de prestations.
Mise à disposition d’une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows(outils, portail,...)
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Ecologie, évolution et biologie environnementale« Ecologie, évolution et biologie environnementale » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :ISO 9001:2015 (http://abims.sb-roscoff.fr/sites/abims.sb-roscoff.fr/files/paq.pdf)
IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)
Conditions générales d'utilisation :
ABiMS est en lien avec les services et structures
EMBRC-France, France Génomique
Portée internationale de ABiMS
EMBRC ERIC (http://www.embrc.eu/)
ELIXIR (https://elixir-europe.org/)