IFB

IFB

Autres noms	Institut Français de Bioinformatique, ELIXIR France, IFB core Institut français de bioinformatique, UAR 3601
URL	https://www.france-bioinformatique.fr/
Tutelles	CNRS, CEA, INRAE, Inria, INSERM
Identifiants
RNSR	201321719F
ROR	045f7pv37
Infrastructure nationale	IR
Noeud français	ELIXIR
Type d'infrastructure	Distribuée
Localisation	Evry

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L’Institut Français de Bioinformatique, IFB, est une infrastructure nationale de service en bioinformatique (calcul, stockage, outils, bases de données, accompagnements de projets, formations). Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. L'IFB fédère les services et les ressources de 31 plateformes en bioinformatique coordonnées par la plateforme IFB-core. Ces services consistent à :

• Fournir un accès à des bases de données spécialisées à haute valeur ajoutée issues de l’expertise scientifique du laboratoire d’accueil de la plateforme
• Mettre à disposition des outils et des services en ligne correspondant aux domaines d’expertise du laboratoire d’accueil de la plateforme
• Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à la gestion et l’analyse des données des sciences du vivant
• Fournir un appui aux projets scientifiques de la communauté des sciences du vivant et assurer leur hébergement sur une infrastructure informatique adaptée
• Offrir des formations en bioinformatique

Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/IFB-ElixirFr. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données https://ressources.france-bioinformatique.fr/fr/services/donnees (d'après la Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche).

L'IFB est le noeud français, ELIXIR-FR de l’infrastructure de recherche européenne d’ELIXIR.

L'IFB a développé, en coopération avec MetaboHUB, Workflow4Metabolomics, W4M, portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

Domaines scientifiques :

Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes

Thématique et/ou mots clés :

• Bioinformatique

Certification/Label :

Centre de référence thématique (https://recherche.data.gouv.fr/fr/page/centres-de-reference-thematiques-expertises-par-domaine-scientifique)

Offre de services de IFB

• FAIR-Checker (Outils de gestion des données)
• W4M (Outils de gestion des données)
• Orphanet (Plateforme d'accès)
• ABiMS (Plateforme de calcul)
• ARTbio (Plateforme de calcul)
• ATGC (Plateforme de calcul)
• AuBI (Plateforme de calcul)
• BiGEst (Plateforme de calcul)
• BiGR (Plateforme de calcul)
• Bilille (Plateforme de calcul)
• CBiB (Plateforme de calcul)
• DAC (Plateforme de calcul)
• GenOuest (Plateforme de calcul)
• GenoToul Bioinfo (Plateforme de calcul)
• MBI-DS4H (Plateforme de calcul)
• MicroScope (Plateforme de calcul)
• Migale (Plateforme de calcul)
• P3M (Plateforme de calcul)
• PACA BioInfo (Plateforme de calcul)
• PRABI Lyon-Gerland (Plateforme de calcul)
• Pasteur HUB (Plateforme de calcul)
• PlantBioInfoPF (Plateforme de calcul)
• RPBS (Plateforme de calcul)
• South Green (Plateforme de calcul)
• iCONICS (Plateforme de calcul)

IFB est en lien avec les services et structures

France Grilles, IDRIS, France Génomique, CCRT, MetaboHUB, CINES, CC-IN2P3, CAD, CRefIX, MGP, IPHC, Inist-CNRS, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques

Portée internationale de IFB

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)

ESFRI Landmark (https://www.esfri.eu/)

Unité d’appui à la recherche

Centre National de la Recherche Scientifique

Le ROR en est un identifiant unique dédié aux organismes de recherche. Le Research Organization Registry (ROR) est une base de données collaborative qui comprend des identifiants et des métadonnées pour plus de 102 000 organisations impliquées dans la recherche

Findable, Accessible, Interoperable, Reusable : principes appliqués aux données pour les rendre faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables.