Shanoir

De Cat OPIDoR
  Shanoir
Type de service Outils de gestion des données
Statut En production
Autres noms SHAring iN vivO Imaging Resources
URL https://shanoir.irisa.fr, https://project.inria.fr/shanoir/
Contact developers_shanoir-request@inria.fr
Localisation Rennes
Structure d'appartenance IRISA
Tutelles Inria, CNRS, Inserm, Université de Rennes


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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Shanoir (SHAring iN vivO Imaging Resources) est une plateforme web pour la recherche clinique et préclinique, conçue pour importer, partager, archiver, rechercher et visualiser tout type de données d'imagerie médicale.

Elle fournit un accès web convivial et sécurisé et offre un flux de travail intuitif pour faciliter la collecte et l'extraction de données d'imagerie à partir de sources multiples et un wizzard pour faciliter le remplissage des métadonnées. Elle est dotée de nombreuses fonctionnalités telles que la pseudonymisation des données pour toutes les importations, la conversion automatique NIfTI, la prise en charge d'études cliniques multicentriques...

Shanoir offre une organisation des données basée sur une ontologie (OntoNeuroLOG). Cela facilite notamment la réutilisation des données et des métadonnées, l'intégration des données traitées et la traçabilité par une approche évolutive.

De plus, Shanoir est une plateforme complète dans laquelle il est facilement possible d'intégrer des outils de traitement existants ou développer son propre flux de travail en utilisant l'interface REST, l'interface DICOMWeb, ShanoirUploader ou des scripts Python existants pour la recherche et le téléchargement.

Elle était, au départ, conçue pour la neuro-imagerie, mais son utilisation est désormais ouverte à tous les types d'organes.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines Thématique et/ou mots clés :

  • Imagerie médicale

Type de données :Données d'imagerie médicale, BIDS, MR, CT, PT, EEG, Bruker

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique en recherche clinique et préclinique Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Cliniciens, Doctorants et Ingénieurs


Conditions d'usage : Le logiciel est publié sous licence GPL v3.0.

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Shanoir est en lien avec les services et structures

FLI, Euris Cloud Santé



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IRISAGenOuest
Shanoir