InforBio

ARTbio
Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://www.artbio.fr/
Contact	artbio@listes.upmc.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IBPS
Tutelles	INSERM, CNRS, Sorbonne Université

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ARTbio s’appuie sur l’outil Galaxy, une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de logiciels d’analyses de données. Galaxy a été créé pour décrire et reproduire précisément les chaînes de traitements informatiques. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. Une interface web permet de suivre pas à pas les étapes de l’analyse à réaliser et de tester facilement ses différents paramètres. Une communauté s’est formée autour du projet Galaxy, et ses membres enrichissent en permanence la plateforme des logiciels qu’ils ont développés ou qui ont été rendus publics.

Pour l’équipe de la plateforme, l’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses.

Mais ARTbio souhaite être plus qu’une simple plateforme de service et continuer à développer de nouveaux logiciels et à participer à l’enrichissement du système Galaxy. L’équipe d’ARTbio développe ainsi actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Plateforme de bioinformatique
Génomique

Type de données :

Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

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IFB

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Structure	Services proposés
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