IFB
Autres noms | Institut Français de Bioinformatique, ELIXIR France |
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URL | http://www.france-bioinformatique.fr/ |
Tutelles | CNRS, CEA, INRAE, INRIA, INSERM |
Identifiant dans un autre catalogue | https://appliweb.dgri.education.fr/rnsr/PresenteStruct.jsp?numNatStruct=201321719F&PUBLIC=OK (RNSR) |
L’Institut Français de Bioinformatique, IFB, est une infrastructure nationale de service en bioinformatique. Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. L'IFB fédère les services et les ressources de 31 plateformes en bioinformatique dont l'IFB-core. Ces services consistent à :
- Fournir un accès à des bases de données spécialisées à haute valeur ajoutée issues de l’expertise scientifique du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition des outils et des services en ligne correspondant aux domaines d’expertise du laboratoire d’accueil de la plateforme
- Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à la gestion et l’analyse des données des sciences du vivant
- Fournir un appui aux projets scientifiques de la communauté des sciences du vivant et assurer leur hébergement sur une infrastructure informatique adaptée
- Offrir des formations en bioinformatique
L’accès aux données produites par l’infrastructure IFB est restreint : les données restent accessibles uniquement aux propriétaires et aux collaborateurs avant publication des résultats.
L'IFB est le noeud français, ELIXIR-FR de l’infrastructure de recherche européenne d’ELIXIR.
L'IFB a développé, en coopération avec MetaboHUB, Workflow4Metabolomics, W4M, portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.
Offre de services de IFB
- FAIR-Checker (Outils de gestion des données)
- W4M (Outils de gestion des données)
- Orphanet (Plateforme d'accès)
- ABiMS (Plateforme de calcul)
- ARTbio (Plateforme de calcul)
- ATGC (Plateforme de calcul)
- AuBI (Plateforme de calcul)
- BiGEst (Plateforme de calcul)
- BiGR (Plateforme de calcul)
- Bilille (Plateforme de calcul)
- CBiB (Plateforme de calcul)
- DAC (Plateforme de calcul)
- GenOuest (Plateforme de calcul)
- GenoToul Bioinfo (Plateforme de calcul)
- MBI-DS4H (Plateforme de calcul)
- MicroScope (Plateforme de calcul)
- Migale (Plateforme de calcul)
- P3M (Plateforme de calcul)
- PACA BioInfo (Plateforme de calcul)
- PRABI Lyon-Gerland (Plateforme de calcul)
- Pasteur HUB (Plateforme de calcul)
- PlantBioInfoPF (Plateforme de calcul)
- RPBS (Plateforme de calcul)
- South Green (Plateforme de calcul)
- iCONICS (Plateforme de calcul)
IFB est en lien avec les services et structures
France Grilles, IDRIS, France Génomique, CCRT, MetaboHUB, CAD, CINES, CC-IN2P3, IPHC, Inist-CNRS, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques, MGP, CRefIX
Portée internationale de IFB
ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/), ESFRI Landmark (https://www.esfri.eu/)