W4M
| Type de service | Outils de gestion des données |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Workflow4Metabolomics 3.0 |
| URL | https://workflow4metabolomics.org/, https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr/ |
| Contact | support * AT * workflow4metabolomics.org |
| Localisation | Villenave d'Ornon |
| Structure d'appartenance | MetaboHUB, IFB |
| Tutelles | CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université, Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.
W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement, devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Analyse métabolomique
- Annotation
- Galaxy
- Bioinformatique
Type de données :Données métabolomiques
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd
Politiques : Politique de données
Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur
Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation : https://ifb-elixirfr.gitlab.io/usegalaxy-fr/welcome//common/terms.html