InforBio
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| Type de service | Plateforme de calcul |
| Statut | En production |
| Nom développé | Plateforme de bio-informatique InforBio |
| Autres noms | |
| URL | https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-de-bio-informatique-artbio/, https://www.artbio.fr |
| Contact | inforbio@sorbonne-universite.fr |
| Localisation | Paris |
| Structure d'appartenance | IBPS, IFB |
| Tutelles | CNRS, Sorbonne Université |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
La plateforme repose sur trois piliers :
- l'analyse de données (services d'analyse, projets collaboratifs)
- le transfert de compétences analytiques (formation, clinique d'analyse et de données)
- le développement d'outils (création d'outils, de workflows, d'environnements d'analyse, de solutions de stockage)
InforBio héberge des services de stockage d'une capacité de 1 Po et des services web : les serveurs Mississippi Galaxy, Rstudio, Jupyterhub, Galaxy.
InforBio développe des outils :
- Metavisitor : ensemble d'outils Galaxy pour la détection de virus dans les données de séquençage à grande profondeur
- GalaxyKlickStart : playbook Ansible pour le déploiement automatisé des serveurs Galaxy
- un dépôt et un toolshed
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
PE6 Sciences informatiques et informatique
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
- Génomique
- Logiciel
- Analyse à grande échelle
- Séquençage
Type de données :Données computationnelles
Communauté d'utilisateurs : Communautés académique et privée Usagers et bénéficiaires :Biologistes, Médécins
Conditions d'usage : La plateforme est ouverte à tous les chercheurs et équipes travaillant en biologie ou en médecine.
Conditions tarifaires :
Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)
Conditions générales d'utilisation :
InforBio est en lien avec les services et structures