PRABI-AMSB

  PRABI-AMSB

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme d'Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques
URL	http://amsb.prabi.fr/contact.html
Contact	contact-AT-prabi-DOT-fr
Localisation	Lyon, Villeurbanne
Structure d'appartenance	IFB, BioEEnViS
Tutelles	Université Claude Bernard Lyon 1

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Analyse

Documentation

Stockage

Exposition

Réutilisation

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Le PRABI-AMSB est une plateforme de bioinformatique de l'Université Lyon 1 créée en 2010 et rattachée à la Fédération de Recherche BioEEnvis.

Au niveau national, le PRABI-AMSB est labélisé plateforme membre de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) - noeud français de l'infrastructure européenne de bioinformatique d Elixir. Le PRABI-AMSB est par ailleurs partenaire de l'Infrastructure France Génomique et contribue au traitement de données de ses PF associées.

Ses missions consistent en :

• La mise à disposition de moyens de calcul et de stockage pour la bioinformatique (cluster, service galaxy.prabi.fr, cloud académique),
• L'accompagnement expert de projets bioinformatiques (de l'idée à la publication),
• La recherche et le développement en bioinformatique et biologie systémique,
• La valorisation de la recherche en bioinformatique à travers le transfert de méthodes,
• La formation des biologistes à l'utilisation des outils bioinformatiques.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS6 Immunité, infection et immunothérapie; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Les services du PRABI-AMSB sont destinés prioritairement aux personnels de la FR BioEEnviS et de l’UCBL mais la plateforme est ouverte à tous les organismes publics ainsi qu’aux industriels. Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Industriels

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Les tarifs sont présentés sur cette page : http://amsb.prabi.fr/charge_prabi_2021.pdf

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

PRABI-AMSB est en lien avec les services et structures

France Génomique

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
BioEEnViS	VirHostNet PRABI-AMSB
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.