Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

  Pasteur HUB

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Bioinformatics and Biostatistics HUB, Plateforme de bioinformatique de l'Institut Pasteur
URL	https://research.pasteur.fr/fr/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub
Contact	bioinfo@pasteur.fr bionfo-ask@pasteur.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IFB
Tutelles	Institut Pasteur, CNRS

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

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La plateforme de bio-informatique de l’Institut Pasteur associe le Centre d’Informatique pour la Biologie (CIB) et la plateforme de Bioanalyse Génomique (PFBaG). Ses missions incluent la mise à disposition d’outils et d’expertise bio-informatiques, et un accompagnement à l’interprétation biologique des données générées par les projets de recherche en génomique. Le CIB propose de nombreuses ressources bio-informatiques et prend en charge les volets informatiques des nouveaux développements, tandis que PFBaG fournit une expertise bio-informatique et propose des stratégies d’analyse originales. En interaction étroite avec les plates-formes « humides » de la Genopole Pasteur, la plateforme propose ses compétences pour la plupart des applications liées au séquençage à haut débit (recherche de variants, identification d’agents infectieux, analyses RNA-Seq et ChIP-Seq, etc.).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : accès restreint aux membres de l'Institut Pasteur sauf via les services web (galaxy.pasteur.fr par ex)

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur est en lien avec les services et structures

France Génomique, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques

Portée internationale de Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur
Institut Pasteur	CeRIS Institut Pasteur : Plateforme de Data management Institut Pasteur : Entrepôt ShareLoc.XYZ Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

Centre National de la Recherche Scientifique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.