Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

  Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Bioinformatics and Biostatistics HUB, Plateforme de bioinformatique de l'Institut Pasteur
URL	https://research.pasteur.fr/fr/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub
Contact	bioinfo@pasteur.fr bionfo-ask@pasteur.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IFB, Institut Pasteur
Tutelles	Institut Pasteur, CNRS, CEA, INRAE, Inria, Inserm
Identifiants
RNSR	201421786Z

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

Exposition

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Le Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur apporte un support en biologie computationnelle aux unités de recherche et plateformes de l’Institut Pasteur.

L'expertise de l'équipe est vaste, et inclut entre autres l'analyse de données multi-omiques, la statistique, et le développement logiciels.

Ils interagissent avec les scientifiques de l'Institut Pasteur de nombreuses manières, qu'il s'agisse de conseil ponctuel, de projets collaboratifs, ou de formations.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :Données produites : Workflows et pipelines scientifiques, applications web scientifiques, bases de données scientifiques, modélisations mathématiques et statistiques, données issues d’analyses. Données analysées : données Single-cell, données « bulk » transcriptomiques et épigénomiques, données protéomiques et métabolomiques, données omiques spatiales, données biomarqueurs (qPCR, ELISA multiplex, cytométrie en flux, etc), séquences d'ADN (génomique, génomique comparative, analyse de variants), données phylogénétiques et phylogénomiques, données métagénomiques.

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques de l'Institut Pasteur Usagers et bénéficiaires :Chercheurs

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : accès restreint aux membres de l'Institut Pasteur sauf via les services web (galaxy.pasteur.fr par ex)

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur est en lien avec les services et structures

France Génomique, CNRS Biologie, CNRS Sciences informatiques

Portée internationale de Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur InforBio
Institut Pasteur	CeRIS Institut Pasteur : Plateforme de Data management Institut Pasteur : Entrepôt ShareLoc.XYZ Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.