« W4M » : différence entre les versions

W4M
Type de service	Outils de gestion des données
Statut	En production
Nom développé	Workflow4Metabolomics 3.0
URL	https://workflow4metabolomics.org, https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr
Contact	support * AT * workflow4metabolomics.org
Localisation	Villenave d'Ornon
Structure d'appartenance	MetaboHUB, IFB
Tutelles	CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université
Tutelles Étrangères	Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham

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Dernière version du 23 octobre 2026 à 11:00

Workflow4Metabolomics, W4M, est un portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.

W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement, devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Analyse métabolomique
Annotation
Galaxy
Bioinformatique

Type de données :Données métabolomiques

Périmètre de communauté : ESR, thématique, privé, national, international

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée

Usagers et bénéficiaires :chercheur (public et privé), doctorants

Politiques : https://workflow4metabolomics.org/data-policy

Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : https://ifb-elixirfr.gitlab.io/usegalaxy-fr/welcome//common/terms.html

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet URGI Migale DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur InforBio Madbot PhyML
MetaboHUB	W4M

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 |Localisation=Villenave d'Ornon
 |StructureAppartenance=MetaboHUB, IFB
-|Tutelle=CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université, Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham
+|Tutelle=CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université
+|TutelleEtrangere=Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham
 |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation
 |International=Non
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 |PerimetreCommunaute=ESR, thématique, privé, national, international
 |Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée
-|Beneficiaire=Chercheurs (public et privé), doctorants
+|Beneficiaire=chercheur (public et privé), doctorants
 |Science ouverte=Politique de données
 |Politique de données=https://workflow4metabolomics.org/data-policy