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W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. '''Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement''', devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.
W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. '''Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement''', devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.
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|Discipline=Vie & Santé
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|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
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|Thematique=Analyse métabolomique, Annotation, Galaxy, Bioinformatique
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|Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée
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|Beneficiaire=Chercheurs (public et privé), doctorants
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[[Catégorie:Annuaire CNRS]][[Catégorie:Annuaire CNRS-INSB]]
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Dernière version du 22 avril 2026 à 15:00

  W4M
Type de service Outils de gestion des données
Statut En production
Nom développé Workflow4Metabolomics 3.0
URL https://workflow4metabolomics.org, https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr
Contact support * AT * workflow4metabolomics.org
Localisation Villenave d'Ornon
Structure d'appartenance MetaboHUB, IFB
Tutelles CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université
Tutelles Étrangères Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse
Documentation
Exposition
Réutilisation


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Workflow4Metabolomics, W4M, est un portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.

W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement, devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Analyse métabolomique
  • Annotation
  • Galaxy
  • Bioinformatique

Type de données :Données métabolomiques

Périmètre de communauté : ESR, thématique, privé, national, international

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé), doctorants

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : https://ifb-elixirfr.gitlab.io/usegalaxy-fr/welcome//common/terms.html



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
MicroScope
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
URGI
Migale
DAC
FAIR-Checker
PRABI-AMSB
CUBIC
Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur
InforBio
Madbot
MetaboHUBW4M

Digital Object Identifier

Enseignement Supérieur et Recherche

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