InforBio

  InforBio

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Nom développé	Plateforme de bio-informatique InforBio
URL	https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-de-bio-informatique-artbio/, https://www.artbio.fr
Contact	inforbio@sorbonne-universite.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IBPS, IFB
Tutelles	CNRS, Sorbonne Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

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InforBio est une plateforme pour aider les chercheurs à analyser des données biologiques et médicales grâce à des outils et des méthodes bioinformatiques de pointe.

La plateforme repose sur trois piliers :

• l'analyse de données (services d'analyse, projets collaboratifs)
• le transfert de compétences analytiques (formation, clinique d'analyse et de données)
• le développement d'outils (création d'outils, de workflows, d'environnements d'analyse, de solutions de stockage)

InforBio héberge des services de stockage d'une capacité de 1 Po et des services web : les serveurs Mississippi Galaxy, Rstudio, Jupyterhub, Galaxy.

InforBio développe des outils :

• Metavisitor : ensemble d'outils Galaxy pour la détection de virus dans les données de séquençage à grande profondeur
• GalaxyKlickStart : playbook Ansible pour le déploiement automatisé des serveurs Galaxy
• un dépôt et un toolshed

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Génomique
• Logiciel
• Analyse à grande échelle
• Séquençage

Type de données :Données computationnelles

Périmètre de communauté : ESR, privé, national

Usagers et bénéficiaires :Biologistes, Médécins

Conditions d'usage : La plateforme est ouverte à tous les chercheurs et équipes travaillant en biologie ou en médecine.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

InforBio est en lien avec les services et structures

Inserm, France Génomique

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IBPS	InforBio
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet URGI Migale DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur InforBio Madbot

Enseignement Supérieur et Recherche

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.