AuBI
| Type de service | Plateforme de calcul |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Auvergne BioInformatique |
| URL | https://mesocentre.uca.fr/projets-associes/plateforme-aubi/plateforme-aubi-70146.kjsp |
| Contact | support.dsi@uca.fr, nadia.goue@uca.fr, pierre.peyret@uca.fr |
| Localisation | Aubière |
| Structure d'appartenance | IFB |
| Tutelles | Université de Clermont-Ferrand, CNRS-INSB, CNRS-INEE, INRAE |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
La plateforme Auvergne BioInformatique, AuBI, rassemble les ressources bioinformatiques du site auvergnat, et s'appuie sur les ressources en calcul et en stockage du Mésocentre Clermont-Auvergne. Elle est associée à l'Institut Français de Bioinformatique ainsi qu'à la plateforme du PRABI .
Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par BioMAJ. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy.
La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface BioMAJWatcher.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
AuBI est en lien avec les services et structures