South Green
| Type de service | Plateforme de calcul |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Plateforme South Green de bioinformatique, SGBP |
| URL | https://www.southgreen.fr/ |
| Contact | admin.bioinfo@cirad.fr |
| Localisation | Montpellier |
| Structure d'appartenance | AGAP, IFB |
| Tutelles | Cirad, IRD, Inrae, SupAgro, Alliance Biodiversity international-CIAT |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
La plateforme assure :
- Le développement de méthodes et outils originaux pour l’analyse des données moléculaires dans les domaines de l’annotation des génomes et des transcriptomes, de la phylogénie, du génotypage par séquençage,…
- Le développement de hubs par espèce végétale (Banana genome hub, Coffee genome hub,..) où sont regroupées et rendues interopérables les applications utiles pour l’étude des génomes.
- des formations spécialisées en bioinformatique (analyse des séquences biologiques, Galaxy) et informatique (logiciel R, Perl, Linux) pour les biologistes et les étudiants.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage : Être partenaire d'un projet en lien avec les plantes méditerranéenes et tropicales.
Conditions tarifaires : Accès gratuit à la puissance de calcul, chaque utilisateur bénéficie de 150 Go de stockage gratuit pour son /home, au-delà, tout espace de stockage ouvert pour un projet est facturé. L’espace /work est gratuit mais avec une contention dans le temps.
Certification/Label :ISO 9001 : 2008 (?)
Conditions générales d'utilisation :