South Green
| Type de service | Plateforme de calcul |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Plateforme South Green de bioinformatique, SGBP |
| URL | https://www.southgreen.fr/ |
| Contact | admin.bioinfo@cirad.fr |
| Localisation | Montpellier |
| Structure d'appartenance | Agap, IFB |
| Tutelles | Cirad, IRD, Inrae, SupAgro, Alliance Biodiversity international-CIAT |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Page en construction
La plateforme South Green de bioinformatique est dédiée à la bioinformatique appliquée à la génétique et à la génomique des plantes tropicales et méditerranéennes d'intérêt agronomique. C’est un réseau de bioinformaticiens qui propose des méthodes innovantes et des ressources de calcul et de stockage des données.
La plateforme assure :
- Le développement de méthodes et outils originaux pour l’analyse des données moléculaires dans les domaines de l’annotation des génomes et des transcriptomes, de la phylogénie, du génotypage par séquençage,…
- Le développement de hubs par espèce végétale (Banana genome hub, Coffee genome hub,..)où sont regroupées et rendues interopérables les applications utiles pour l’étude des génomes.
- des formations spécialisées en bioinformatique (analyse des séquences biologiques, Galaxy) et informatique (logiciel R, Perl, Linux) pour les biologistes et les étudiants.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage : Être partenaire d'un projet en lien avec les plantes méditerranéenes et tropicales.
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :