« W4M » : différence entre les versions

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|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes
|Thematique=Analyse, Annotation, Galaxy
|Thematique=Analyse métabolomique, Annotation, Galaxy, Bioinformatique
|TypeDonnee=Données métabolomiques
|TypeDonnee=Données métabolomiques
|Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée
|Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée

Version du 10 janvier 2020 à 15:27

  W4M
Type de service Outils de gestion des données
Statut En production
Autres noms Workflow4Metabolomics 3.0
URL https://workflow4metabolomics.org/
Contact support * AT * workflow4metabolomics.org
Localisation Villenave d'Ornon
Structure d'appartenance MetaboHUB
Tutelles


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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Workflow4Metabolomics, M4W, est un portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.

W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Analyse métabolomique
  • Annotation
  • Galaxy
  • Bioinformatique

Type de données :Données métabolomiques

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd


Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IFBW4M
GenoToul Bioinfo
Bilille
PACA BioInfo
PRABI Lyon-Gerland
AuBI
CBiB
iCONICS
MicroScope
Pasteur HUB
RPBS
BiGR
P3M
ABiMS
ATGC
MBI-DS4H
GenOuest
BiGEst
South Green
Orphanet
PlantBioInfoPF
Migale
ARTbio
DAC
FAIR-Checker
PRABI-AMSB
MetaboHUBW4M