PhyML

  PhyML

Type de service	Outils de gestion des données
Statut	En production
URL	https://bio.tools/phyml
Contact	support-bio-tools@sdu.dk
Localisation
Structure d'appartenance	IFB
Tutelles	CNRS, CEA, INRAE, Inria, Inserm

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

PhyML est un logiciel qui utilise des approches statistiques modernes pour analyser les alignements de séquences nucléotidiques ou d'acides aminés dans un cadre phylogénétique.

L'outil principal de ce logiciel construit des phylogénies selon le critère du maximum de vraisemblance. PhyTime est un autre outil du logiciel PhyML qui se concentre sur l'estimation des dates de divergence dans un cadre bayésien.

PhyREX adapte le modèle spatial Lambda-Fleming-Viot à des données génétiques géoréférencées.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE1 Mathématiques; PE6 Sciences informatiques et informatique LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• analyse phylogénétique
• statistiques évolutives
• modélisation bayésienne
• génétique des populations
• séquences nucléotidiques
• séquences protéiques

Type de données :données de simulation, données spatiales, données temporelles, données statistiques

Périmètre de communauté : ESR, public, privé, national, international

Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Ingénieur

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

PhyML est en lien avec les services et structures

ELIXIR

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB MicroScope RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet URGI Migale DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB CUBIC Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l'Institut Pasteur InforBio Madbot PhyML

Enseignement Supérieur et Recherche