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|Description='''Workflow4Metabolomics''', '''W4M''', est un '''portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques'''. | |Description='''Workflow4Metabolomics''', '''W4M''', est un '''portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques'''. | ||
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation. | '''L’Institut Français de Bioinformatique''' ([[IFB]]) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation. | ||
W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. | W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. |
Version du 31 janvier 2020 à 16:34
Type de service | Outils de gestion des données |
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Statut | En production |
Autres noms | Workflow4Metabolomics 3.0 |
URL | https://workflow4metabolomics.org/ |
Contact | support * AT * workflow4metabolomics.org |
Localisation | Villenave d'Ornon |
Structure d'appartenance | MetaboHUB |
Tutelles | |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.
W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Analyse métabolomique
- Annotation
- Galaxy
- Bioinformatique
Type de données :Données métabolomiques
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd
Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur
Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :