W4M

  W4M

Type de service	Outils de gestion des données
Statut	En production
Autres noms	Workflow4Metabolomics 3.0
URL	https://workflow4metabolomics.org/, https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr/
Contact	support * AT * workflow4metabolomics.org
Localisation	Villenave d'Ornon
Structure d'appartenance	MetaboHUB, IFB
Tutelles	CEA, CNRS, INRAE, Sorbonne Université, Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Exposition

Réutilisation

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Workflow4Metabolomics, W4M, est un portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques.

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation.

W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement, devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Analyse métabolomique
• Annotation
• Galaxy
• Bioinformatique

Type de données :Données métabolomiques

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'utilisateur final

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : https://ifb-elixirfr.gitlab.io/usegalaxy-fr/welcome//common/terms.html

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IFB	W4M GenoToul Bioinfo Bilille PACA BioInfo PRABI Lyon-Gerland AuBI CBiB iCONICS MicroScope Pasteur HUB RPBS BiGR P3M ABiMS ATGC MBI-DS4H GenOuest BiGEst South Green Orphanet PlantBioInfoPF Migale ARTbio DAC FAIR-Checker PRABI-AMSB
MetaboHUB	W4M

Centre National de la Recherche Scientifique

Digital Object Identifier