« GnpIS » : différence entre les versions
(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo= |NomService=GnpIS |TypeService=Entrepôt de données |StatutService=En production |NomAlternatif=Genetic and Genomic Information System |UrlServic… ») |
m (Remplacement de texte : « IDre3data=R » par « IDre3data=10.17616/R ») |
||
(7 versions intermédiaires par le même utilisateur non affichées) | |||
Ligne 8 : | Ligne 8 : | ||
|ContactMel=urgi-contact at versailles.inra.fr | |ContactMel=urgi-contact at versailles.inra.fr | ||
|Localisation=Versailles | |Localisation=Versailles | ||
|StructureAppartenance=URGI, PlantBioInfoPF | |StructureAppartenance=URGI,PlantBioInfoPF | ||
|Tutelle=INRAE | |Tutelle=INRAE | ||
|IdentifiantService= | |IdentifiantService= | ||
|IDRNSR= | |IDRNSR= | ||
|IDre3data=R3RF6C | |IDre3data=10.17616/R3RF6C | ||
|IdentifiantAlternatif= | |IdentifiantAlternatif= | ||
|PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | ||
}} | |||
{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=48.80183, 2.08845 | |CoordonneeGeographique=48.80183, 2.08845 | ||
}} | }} | ||
Ligne 20 : | Ligne 22 : | ||
|Description=GnpIS est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRAE venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques). | |Description=GnpIS est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRAE venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques). | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes | ||
|Thematique= | |Thematique=Analyse de données de séquençage NGS, Analyse de séquences, | ||
Cartographie, Génomique comparative | |||
|TypeDonnee= | |TypeDonnee= | ||
|Communaute= | |Communaute= | ||
Ligne 28 : | Ligne 31 : | ||
|ConditionUsage=L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente. | |ConditionUsage=L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente. | ||
|ModeleEconomique= | |ModeleEconomique= | ||
|Certification= | |Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=1 | ||
|Cgu= | |Cgu=https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation | ||
|Relation= | |Relation=PlantBioInfoPF | ||
|PorteeInternationale= | |PorteeInternationale= | ||
}} | }} |
Dernière version du 20 juillet 2023 à 13:19
Type de service | Entrepôt de données |
---|---|
Statut | En production |
Autres noms | Genetic and Genomic Information System |
URL | https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis, https://urgi.versailles.inra.fr/Data |
Contact | urgi-contact at versailles.inra.fr |
Localisation | Versailles |
Structure d'appartenance | URGI, PlantBioInfoPF |
Tutelles | INRAE |
Identifiants | |
re3data | 10.17616/R3RF6C |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :
- Analyse de données de séquençage NGS
- Analyse de séquences
- Cartographie
- Génomique comparative
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage : L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente.
Conditions tarifaires :
Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=1)
Conditions générales d'utilisation : https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation
GnpIS est en lien avec les services et structures
Structure | Services proposés |
---|---|
PlantBioInfoPF | GnpIS WheatIS |
URGI | PlantBioInfoPF GnpIS WheatIS |