PGTB

PGTB

Autres noms	Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux
URL	https://pgtb.fr/
Tutelles	Université de Bordeaux, INRAE
Localisation	Cestas

Service

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
URL	https://pgtb.fr/
Contact	pgtb@inrae.fr, https://pgtb.fr/contactez-nous/
Structure d'appartenance	BioGECO, INRAE Genomics

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Collecte

Analyse

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La Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux, PGTB, est une infrastructure technologique adossée à l’UMR BIOGECO spécialisée en séquençage et en génotypage. La PGTB développe et propose des services faisant appel à des technologies moyen et haut débit reposant sur le séquençage (séquençage de courts et longs fragments d’ADN, métagénomique ciblée, séquençage de génomes et de transcriptomes, métagénomique totale et métatranscriptomique, capture de gènes, …), la recherche et le génotypage de mutations (SNP, INDEL et microsatellites), la quantification de l’expression de gènes et l’analyse d’ADN environnemental, sensible ou ancien en laboratoire confiné.

La PGTB apporte ses services et son savoir-faire pour des projets régionaux, nationaux et internationaux dans des domaines aussi variés que l’environnement, l’agronomie, ou la santé. Elle a pour vocation de satisfaire les besoins en génotypage et en séquençage liés aux activités de recherche des laboratoires, et d’être un centre ouvert à l’ensemble de la communauté scientifique académique et aux acteurs industriels.

La PGTB est engagée dans les certifications ISO 9001 et NFX 50-900.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

• Génomique
• Séquençage
• Génotypage
• Biodiversité
• Metabarcoding
• Longs-reads
• Bioanalyse

Type de données :Génomique

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique académique et aux acteurs industriels Usagers et bénéficiaires :Chercheurs

Conditions d'usage : Plusieurs modes d'accès possibles en fonction des projets et besoins : prestation, autonomie, R&D, collaboration. Pour soumettre une demande à la plateforme PGTB, envoyez un mail à l'adresse pgtb@inrae.fr ou via le formulaire : https://pgtb.fr/contactez-nous/ et décrivez votre projet en précisant la technique, l’équipement concerné, le type et le nombre d’échantillons. La plateforme vous recontactera pour vous informer de la faisabilité du projet et vous enverra un devis valable 6 mois

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (https://qualite.ibisa.net/certificats/genome-transcriptome-bordeaux-iso.pdf)

NFX 50-900:2016 (https://qualite.ibisa.net/certificats/genome-transcriptome-bordeaux-nfx.pdf)

IBISA (https://www.ibisa.net/plateformes/)

ISC INRAE (https://www.inrae.fr/liste-infrastructures-scientifiques-collectives)

CNOC (?)

Conditions générales d'utilisation : https://pgtbnet.files.wordpress.com/2023/01/f-conditions-generales-pgtb-2023-01-26.pdf

PGTB est en lien avec les services et structures

France Génomique, GeT, EPGV, CNRGV, Gentyane

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
BioGECO	Maggot PGTB
INRAE Genomics	GeT Gentyane EPGV PGTB CNRGV INRAE Genomics

Unité Mixte de Recherche

2015

Systèmes de management de la qualité

Système de management intégrant un système de management de la qualité ISO 9001:2015 concernant les exigences pour les plateformes technologiques de recherche en sciences du vivant