« MS4OMICS » : différence entre les versions

MS4OMICS
Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms	Plateforme de protéomique de la MSAP, Mass spectrometry plateform, Clic Imaging (Ancien nom), Top Omics (Ancien nom)
URL	https://msap-lab.fr/proteomique/
Contact	msap-plateformes@univ-lille.fr
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	MSAP
Tutelles	CNRS, Université de Lille

Dernière version du 25 janvier 2024 à 14:24

La plateforme MS4Omics est spécialisée dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie. Elle a pour vocation de mettre à disposition des équipes : des équipements, des compétences scientifiques adaptés aux demandes.

Deux types de services sont offerts par la plateforme :

L’accès direct aux instruments
Les collaborations qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.

La plateforme réalise :

Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés
Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT
Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM
Analyse de protéines intactes. Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation…)
Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon
Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie
Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique.

La plateforme possède différents logiciels d’analyse MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des bases de données internes.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE4 Chimie physique et analytique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Spectrométrie de masse
Protéomique
Paléoprotéomique

Type de données :Données expérimentales, Données instrumentales, Base de données

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche de l'Université de Lille et dans la mesure des possibilités, de l'ESR et acteurs privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html)

Conditions générales d'utilisation :

MS4OMICS est en lien avec les services et structures

Infranalytics, ProFI, OrganOmics, 3DCellOmics

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
MSAP	MSAP : Plateforme spectrométrie de masse FT-ICR MS4OMICS

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 {{Infobox Service
+|Logo=LogoMS4OMICSOrange.jpg
 |NomService=MS4OMICS
 |TypeService=Plateforme d'acquisition
 |StatutService=En production
+|NomAlternatif=Plateforme de protéomique de la MSAP, Mass spectrometry plateform, Clic Imaging (Ancien nom), Top Omics (Ancien nom)
 |UrlService=https://msap-lab.fr/proteomique/
 |ContactMel=msap-plateformes@univ-lille.fr
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 {{Service
-|Description=MS4Omics est spécialisé dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie par spectrométrie de masse.
+|Description=La '''plateforme MS4Omics''' est spécialisée dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie. Elle a pour vocation de mettre à disposition des équipes : '''des équipements, des compétences scientifiques adaptés aux demandes'''.
-Elle fournit des services aux universitaires, aux laboratoires cliniques et aux entreprises, ainsi que des développements méthodologiques et technologiques.
 Deux types de services sont offerts par la plateforme :
+* L’'''accès direct''' aux instruments
+* Les '''collaborations''' qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.
-* l’accès direct aux instruments
+La plateforme réalise :
-* les collaborations qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur
+* Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés
+* Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT
+* Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM
+* Analyse de protéines intactes. Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation…)
+* Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon
+* Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie
+* Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique.
-La plateforme possède différents logiciels d’analyse MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des bases de données internes.
-L’objectif de la Plateforme de Protéomique est de mettre à disposition des équipes qui s’adressent à elle un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions posées, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d’un organisme entièrement séquencé) jusqu’aux plus complexes (quantification des variations, dynamique des modifications post-traductionnelles,…), dans le cadre de collaborations et de prestations.
+La plateforme possède '''différents logiciels d’analyse''' MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des '''bases de données internes'''.
 |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
 |SousDisciplineSciences&Technologies=PE4 Chimie physique et analytique
 |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
-|Thematique=Spectrométrie de masse, Industrie alimentaire
+|Thematique=Spectrométrie de masse, Protéomique, Paléoprotéomique
-|Communaute=Communauté de le recherche de l'Université de Lille et disciplinaire
+|TypeDonnee=Données expérimentales, Données instrumentales, Base de données
-|Beneficiaire=Chercheur, enseignant-chercheur, doctorant
+|Communaute=Communauté de recherche de l'Université de Lille et dans la mesure des possibilités, de l'ESR et acteurs privés
-|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/
+|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels
-|Relation=Infranalytics
+|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html,
-|StatutPage=Page en construction
+|Relation=Infranalytics, ProFI, OrganOmics, 3DCellOmics
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