ProFI
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| Autres noms | Infrastructure Française de protéomique. Proteomics French Infrastructure, Fédération de Recherche nationale ProFI, FR 2048 |
| URL | http://www.profiproteomics.fr/ |
| Tutelles | CNRS, CEA, INSERM |
| Identifiants | |
| RNSR | 202123709J |
| Infrastructure nationale |  IR
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| Type d'infrastructure | Distribuée |
| Localisation | Grenoble |
ProFI - Proteomics French Infrastructure, est l’infrastructure nationale de protéomique, qui s’appuie les trois principales plateformes protéomiques françaises (Grenoble, Strasbourg et Toulouse). Ses missions s’articulent autour de 3 axes :
- La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
- La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
- L’analyse protéomique quantitative d’échantillons biologiques
- L’analyse ciblée de biomarqueurs protéiques dans les fluides et tissus biologiques.
ProFi mène également une action de formation destinée à irriguer l'ensemble de la communauté protéomique française ; par exemple pour permettre aux opérateurs des plateformes protéomiques de prendre en mains l'environnement logiciel qui a été développé par l'infrastructure.
ProFI développe les approches de détection et quantification des protéines et de leurs modifications post-traductionnelles. ProFI offre ses services aux laboratoires académiques et aux industriels, en particulier dans les secteurs pharmaceutique, agroalimentaire et de la bio production.
Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/profiproteomics. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données www.proteomexchange.org
Domaines scientifiques :
Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes