MS4OMICS

  MS4OMICS

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms	Plateforme de protéomique de la MSAP, Mass spectrometry plateform, Clic Imaging (Ancien nom), Top Omics (Ancien nom)
URL	https://msap-lab.fr/proteomique/
Contact	msap-plateformes@univ-lille.fr
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	MSAP
Tutelles	CNRS, Université de Lille

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

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La plateforme MS4Omics est spécialisée dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie. Elle a pour vocation de mettre à disposition des équipes : des équipements, des compétences scientifiques adaptés aux demandes.

Deux types de services sont offerts par la plateforme :

• L’accès direct aux instruments
• Les collaborations qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.

La plateforme réalise :

• Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés
• Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT
• Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM
• Analyse de protéines intactes. Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation…)
• Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon
• Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie
• Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique.

La plateforme possède différents logiciels d’analyse MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des bases de données internes.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE4 Chimie physique et analytique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Spectrométrie de masse
• Protéomique
• Paléoprotéomique

Type de données :Données expérimentales, Données instrumentales, Base de données

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche de l'Université de Lille et dans la mesure des possibilités, de l'ESR et acteurs privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html)

Conditions générales d'utilisation :

MS4OMICS est en lien avec les services et structures

Infranalytics, ProFI, OrganOmics, 3DCellOmics

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
MSAP	MSAP : Plateforme spectrométrie de masse FT-ICR MS4OMICS

Centre National de la Recherche Scientifique

Enseignement Supérieur et Recherche

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.