EDNA

De Cat OPIDoR
EDNA
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes
URL https://leca.osug.fr/eDNA-AnaEE-France-272
Contact stephen.mulero@univ-grenoble-alpes.fr
Localisation Grenoble
Structure d'appartenance LECA, AnaEE-France
Tutelles CNRS, Université Grenoble Alpes, Université Savoie Mont-Blanc


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La plateforme EDNA est spécialisée dans l'approche metabarcoding pour identifier les communautés microbiennes, animales et végétales en utilisant des échantillons environnementaux (sol, eau, fèces etc.). Habituellement, le metabarcode d'ADN est conçu selon la question scientifique, et cible l'ADN multi-copie (ADN de chloroplaste, ADN mitochondrial, ADN ribosomal nucléaire). La plateforme eDNA peut offrir un support pour :
  • la conception des expériences selon la question scientifique, les contraintes techniques et la stratégie pour assurer la qualité des données;
  • extraction d'ADN à grande échelle;
  • amplification d'ADN à grande échelle;
  • la sous-traitance du séquençage avec une entreprise qui fournit un service de haute qualité lors du séquençage d'amplicons;
  • l'analyse des séquences brutes jusqu'à la production d'un tableau de cotingence qui sera ultérieurement analysé par l'écologiste;
  • la discussion sur l'interprétation scientifique en fonction des pièges potentiels de l'approche metabarcoding.


Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé


PE10 Sciences du Système Terre LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

  • Metabarcoding

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : Formulaire pour déposer un projet auprès d'une ou plusieurs plateforme(s) AnaEE-France sur le portail de dépôt de projet : https://isia.cnrs.fr/

Modèle économique :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
AnaEE-FranceSETE
Station des Nouragues
Ecotron Ile de France
Ecotron Européen de Montpellier
PLANAQUA
EcogenO
AnaEE-France Metadata Catalog
AnaEE-France entrepôt
Jardin du Lautaret
EDNA
O3HP
Puéchabon
LECAEDNA