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O
OMERE est un observatoire franco-tunisien qui a pour objectif scientifique l’étude et la compréhension de l'effet des changements globaux affectant les hydrosystèmes méditerranéens cultivés et naturels, particulièrement les changements liés aux actions anthropiques, sur la quantité et la qualité des ressources en eau et en sols.
L''''Observatoire Méditerranéen de l'Environnement Rural et de l'Eau OMERE''' repose sur l'acquisition conjointe à moyen et long terme d'observations structurées sur les régimes d'écoulements, les processus d'érosion physique et chimique des sols, l'évolution de la qualité des eaux superficielles et souterraines, et sur l'évolution spatio-temporelle de l'état et des fonctions de forçage des hydrosystèmes soumis aux actions anthropiques (occupation du sol, aménagements hydro-agricoles, pratiques agricoles et d'usage de l'eau, prélèvements d'eau ...). +
ORDaR (OTELo Research Data Repository) est l’'''entrepôt de données institutionnel''' de l'Observatoire Terre Environnemment de Lorraine ('''OTELo''').ORDaR offre aux chercheurs de l’observatoire un environnement sûr et pérenne pour le dépôt des jeux de données et permet d''''obtenir un DOI''' pour '''citer de manière fiable et pérenne''' les jeux de données dans une publication ou un datapaper.
Les métadonnées décrivant les jeux de données sont ouvertes et décrites dans les normes internationales, elles sont téléchargeables en 4 formats, DataCite, BibteX, JSON et Dublin-Core.
Les ensembles de données produits par les Laboratoires OTELo sont publiés dans ORDaR en libre accès, en accès restreint aux métadonnées seulement ou avec un embargo. La '''réutilisation''' des données est soumise à une '''licence Creative Commons'''. +
OREME DATA ou OREME portail est le site de diffusion des données de l'Observatoire de REcherche Montpelliérain de l'Environnement.
Ce portail de données et de services propose l'accès au catalogue de l'OREME et Bases de données en sciences de l'Univers (BIOMARIA, POLLUX, POLLEN, OCOA, OCOVE, MEDYCYSS, ECOPOP, FORET, EVOPOP, FORAGE, AMMA-CATCH, LTC, GNSS, GAIA, PLATO, SVOM, POLLIMED, ODS, GEK, OMIV, POLLUMINE, REC-THAU, KARST3D, SNOKARST, RLBP).
Propose également des services et outils d'analyse et de visualisation de données ainsi que des webservices géographiques. +
ORRSO est un outil qui signale des ressources en Science Ouverte. L’objectif de cet outil de recherche est de recenser et faciliter l’accès aux ressources pédagogiques sur la science ouverte développées par les universités et organismes de recherches, pour répondre aux questionnements et besoins de formation et d’information des chercheurs du DRIIHM.
Les ressources sont organisées autour de 7 thématiques de recherches:
*Aspect légal et bonnes pratiques de la science ouverte
* Plan de gestion de données
* Données de recherche et métadonnées
*Identifiants pérennes
* Entrepôt et partage de données
* Stockage et archivage
*Valorisation / Publication des données
avec 2 niveaux d'apprentissage:
* Bien débuter
* Pour aller plus loin. +
OSUL Dat@, le portail de données de l’OSUL donne un accès unifié, pour la communauté, aux '''bases de données et logiciels de simulations numériques, modélisation, traitement et réduction de données''' développés ou auxquels ont contribué le Centre de Recherche Astrophysique de Lyon (CRAL) et le laboratoire de Géologie - Terre, Planète, Environnement (LGL-TPE).
Cette plateforme a pour objectifs d’'''augmenter la visibilité des données, de faciliter l’accès et la découverte de ces données et de favoriser la diffusion et la réutilisation des données de recherche'''. +
OSURIS est une Infrastructure de Données Géographiques (IDG) . Cet outil est ouvert à la consultation au public, et plus particulièrement dédié aux chercheurs et étudiants. OSURIS vise à pérenniser, valoriser et partager les données de la recherche menée à l’Observatoire des Sciences de l’Environnement de Rennes (OSERen). Il s’inscrit dans la logique de la directive INSPIRE (INfrastructure for SPatial InfoRmation in Europe, voir la directive Inspire).
OSURIS se base sur un ensemble d’outils interopérables, modulaires et libres, incluant:
*le catalogue de métadonnées GeoNetwork,
*le serveur de données spatialisées Geoserver,
*un visualiseur cartographique, ouvert aux données web disponibles (fond de cartes Google Map, serveur de carte géologiques du BRGM par exemple),
*un gestionnaire de projet, GeoCMS, développée par la société DotGee.
Portail de services et d'accès aux données géospatialisées de l'OSERen, catalogue de métadonnées, services de visualisation, on trouve sur OSURIS des informations sur différentes données de l’OSERen, notamment les projets Zone Atelier Armorique, HPlus international, InterArctic. +
S
Observatoire de Recherche Environnementales, '''Sea Surface Salinity Observation Service''', '''SSS''', '''collecte, valide et met à disposition des observations de salinité de surface réalisées dans l’océan global''' afin d’améliorer notre compréhension de la variabilité du climat et du cycle de l’eau.
Le '''Service National d'Observation SSS''' est un réseau de '''mesures de salinité de surface océanique''' (SSS) à partir de thermosalinographes (TSG) installés sur des navires d'opportunité. Il repose actuellement sur 11 navires parcourant l’océan global, avec une plus forte concentration de lignes dans le Pacifique tropical et l’Atlantique nord. Les données sont transmises en temps réel pour le suivi des instruments et, après un contrôle qualité automatique, alimentent l’océanographie opérationnelle. Elles sont disponibles à plus haute résolution en temps différé, après validation et correction des dérives instrumentales, pour la recherche. Le SNO SSS assure aussi le suivi temps réel et le traitement temps différé des mesures TSG des navires de recherche hauturiers français. Des produits grillés compilant toutes les sources de données de SSS in situ sont également créés et distribués.
La fugacité de CO2 (fCO2) est aussi mesurée en continu en surface sur 2 navires du réseau SSS. +
O
OpenData ESR est une '''plateforme ministérielle''' de mise à disposition de '''données open data sur l'enseignement supérieur et la recherche'''. Les jeux de données proposés par le ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche sont librement exploitables et répondent aux standards techniques élevés (usage de référentiels officiels permettant d'interpoler les données avec d'autres jeux, documentation). Des exemples de réutilisation des jeux de données sont disponibles en versions numériques dynamiques ou sous forme de notes, rapports, data visualisations.
La plateforme propose également un moteur de recherche des différentes ressources en données (applications, tableaux de bord, API, publications) sur ses domaines : '''[https://data.esr.gouv.fr/FR/ #dataESR]'''
Les jeux de données sous licence ouverte sont synchronisés avec la plateforme interministérielle [[data.gouv.fr]] animée par la mission [[Etalab]]. +
OpenImadis est la plateforme logicielle utilisée par l'entrepôt de données image cid.curie.fr de France Bio Imaging. Il s'agit d'un outil open source, permettant de gérer le cycle de vie des images de l'acquisition (lien avec les microscoscopes et metadata associés) à l'analyse et la publication. +
Opentheso est un gestionnaire de '''thésaurus multilingue et multi-hiérarchique''', '''libre et collaboratif'''. Les termes sont des concepts organisés en collections, les concepts peuvent être enrichis avec la traduction, illustration, alignements…
Il est développé sous la direction de Miled Rousset, responsable de la plateforme technologique Web Sémantique et Thesauri (WST) à la Maison de l’Orient et de la Méditerranée (MOM) et directeur informatique du GDS Frantiq.
Son développement bénéficie du soutien financier du GDS Frantiq, de la Maison de l’Orient et de la Méditerranée et du consortium MASAplus de la TGIR Huma-Num. +
E
Organisation intergouvernementale qui développe une infrastructure Européenne distribuée, ELIXIR permet aux scientifiques dans le domaine des sciences de la vie d’accéder à des ressources telles que des bases de données, des outils logiciels, du matériel de formation, du stockage cloud et des clusters de calcul. Les expériences en Science de la vie génèrent un volume de données et un nombre de logiciels immenses et en augmentation exponentielle. Il est nécessaire de stocker les données, de les rendre accessibles, interopérables et sûres. L’objectif d'ELIXIR est de coordonner ces ressources pour former une infrastructure unique permettant aux scientifiques de trouver et de partager des données, d’échanger des compétences et de convenir des meilleures pratiques dans toute l’Europe. +
R
Organisation internationale, la Research Data Alliance, RDA, met en place les meilleures pratiques en matière de données de la recherche et a comme mission de '''construire des passerelles sociales et techniques pour permettre le libre partage des données, leur réutilisation et leur interopérabilité'''.
Plus de 500 membres de la RDA viennent de France et le CNRS est activement engagé dans la RDA et est responsable de l’animation du '''Nœud national RDA France''' dont l’objectif est de '''faciliter le partage des connaissances entre les acteurs mondiaux et nationaux de la RDA''', d’'''encourager la participation française à la RDA''' et l’'''adoption en France des recommandations et des résultats de la RDA'''. Le MESR soutient le fonctionnement du Noeud National, dans le cadre du Plan National pour la Science Ouverte.
L'une des priorités de RDA France est de faire progresser la certification des entrepôts et services de données en France.
RDA France a proposé, dans le cadre du '''projet ANR BRIDGE (2019-2022)''', une feuille de route afin d'implémenter les '''principes FAIR dans les entrepôts de données''' reposant sur la solution logiciel Dataverse de l'IRD, l'INRIA et le CIRAD. La méthodologie et les résultats sont réutilisables dans d’autres contextes multi-partenaires de l’Enseignement Supérieur de la Recherche en France. +
A
Organisme mondial de « L’atome pour la paix et le développement » au sein de la famille des Nations Unies, l’'''Agence internationale de l'énergie atomique''' ou '''AIEA''', est le '''centre international de la coopération dans le domaine du nucléaire'''. En collaboration avec ses États Membres et ses nombreux partenaires dans le monde, elle œuvre à la promotion de l’utilisation sûre, sécurisée et pacifique des technologies nucléaires. +
C
Outils d'analyse et base de données regroupant les CRISPRs (Clustered Regulary Interspacing Short Palindromic Repeats) identifiés dans les génomes publiés et protéines CAS associées. +
P
P.E.T.R.A.E est un système d’enregistrement des inscriptions latines et grecques mis au point à l’Institut Ausonius, qui recueille les textes épigraphiques de différentes régions où travaillent ses chercheurs et leurs collaborateurs. +
PACA BioInfo est une plateforme d’analyse de données de métagénomique (séquençage Génomique et Transcriptomique), spécialisée en phylogénie moléculaire. +
PACEA Collections est un portail web d'accès aux données de collections patrimoniales, pédagogiques et scientifiques de l'UMR PACEA De la Préhistoire à l’Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie situé à PESSAC en Gironde (33).
Le 1er jeu de données proposé par ce service, est l'anatonomie comparée "animaux non-humains" avec ses 5 sous collections ; Avitek, Crustatek, Mammatek, Piscitek et Herpetotek.
Le 2ème jeu de données proposé par ce portail, est la collection Patrimoniale "Micromorphothèque", qui réunit 1400 Lames minces de micromorphologie accessible librement.
La création de ce portail s’inscrit dans le cadre du Plan de Gestion de Données de la recherche de PACEA (ou Data Management Plan – DMP), en cours de déploiement depuis 2019. Le DMP est l’un des processus d’ouverture des données de la recherche du laboratoire PACEA. Ce portail web est l'une des solutions techniques de ce DMP pour exposer les données de la recherche du laboratoire.
Ce portail web a été développé par l'INIST sous OMEKA classic, un outil de création de bases de données éditorialisées, structurées, accessibles, et visibles sur le web. +
PAGODA, Practical algorithms for ontology-based data access, est un projet de recherche fondamentale dont le but est d'améliorer l'efficacité et la robustesse de l'accès aux données en présence d'ontologies, par le développement de nouveaux algorithmes d'interrogation en présence d'ontologie et de nouvelles méthodes pragmatiques pour gérer de façon raisonnée les données incohérentes. +
PIRATA, Prediction and Research Moored Array in the Tropical Atlantic, est un programme d'océanographie opérationnelle, mis en place en 1997 sous l'égide du programme international CLIVAR (Climate Variability and predictability), dédié à l'étude des interactions océan-atmosphère dans l'Atlantique Tropical et de leur rôle dans la variabilité climatique régionale à des échelles saisonnières, interannuelles ou plus longues.
Mené grâce à une coopération multinationale entre la France, le Brésil et les États Unis, PIRATA maintient un réseau de 18 bouées météo-océaniques en Atlantique Tropical et constitue un réseau d'observations de base pour la prévision climatique et la recherche.
Service National d'Observation (SNO) labélisé. +
POLLUX est une base de données de spectres stellaires synthétiques à très haute résolution développée et maintenue au [[LUPM|Laboratoire Univers et Particules de Montpellier (LUPM)]].
La base de données POLLUX est interopérable suivant les standards d’interrogation et de description de l’IVOA (International Virtual Observatory Alliance). Elle est à ce titre rattachée au Centre d’Expertise Régional (CER) GSO (Observatoire Midi-Pyrénées).
POLLUX distribue essentiellement des spectres d’étoiles dans le domaine visible, et ce pour une gamme étendue de paramètres stellaires en termes de température et gravité de surface, métallicité et composition chimique détaillée. Il s’agit de 16619 spectres calculés sur la base de modèles d’atmosphères 1D performants (MARCS, ATLAS, CMFGEN) et adaptés à chacun des types d’étoiles proposés (de M à O et aux étoiles Wolf-Rayet).
POLLUX permet un accès facilité aux spectres stellaires synthétiques via une interface web explicite, permettant non seulement l’interrogation de la base de données sur les paramètres stellaires fondamentaux (Teff, logg, [Fe/H]), mais également la visualisation d’un ou plusieurs spectres, la visualisation des fichiers descripteurs de données, la convolution des spectres par un signal instrumental, et le téléchargement unitaire ou par paquets dans différents formats.
L’équipe en charge de POLLUX a également développé SPECFLOW, outil pédagogique de comparaison des spectres théoriques de la base avec des spectres observés hébergés dans la base de données PolarBase.
Centre de données et de services, POLLUX est labellisée en tant que Service National d’Observation (SNO) de l’Action Nationale d’Observation N°5 de CNRS Terre & Univers (ANO5). +